述评

  • 植物端粒到端粒(T2T)基因组研究进展与展望

    宫少达;谢文召;赵如鹏;冯康宁;陈玲玲;

    高质量的参考基因组是基因组学研究的基础。目前,大多数的参考基因组仍然是不完整的。随着长读长测序技术的不断发展,完成端粒到端粒(telomere-to-telomere, T2T)基因组组装的物种越来越多。T2T基因组为深入研究着丝粒等复杂区域奠定了基础,对功能基因的挖掘和重要生物机制的研究具有重要意义。本文概述了植物T2T基因组的研究进展,结合实例介绍了相应的组装策略,讨论了T2T基因组的意义和面临的挑战,并对未来的发展前景进行了展望。

    2024年06期 v.43 933-942页 [查看摘要][在线阅读][下载 1440K]
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  • 原核生物的启动子及其研究方法进展

    张小梅;彭萱;龙雨欣;龙中儿;

    启动子是调控转录起始的最基本元件,对原核生物的生存和适应至关重要。深入研究原核生物的启动子有助于了解原核生物的基因表达调控机制,有利于构建智能和高效的工程菌株,进而有利于提高重要代谢物的产量,在合成生物学和代谢工程等领域均具有重要意义。近年来,随着原核生物启动子研究成果的不断积累,大量启动子的序列被克隆、鉴定以及改造,并被尝试用于生产实践。本文介绍了原核生物启动子的结构和类型,详述了启动子预测、结构分析、功能鉴定及其开发应用的方法,最后对该领域的研究进行展望,以期为筛选和鉴定新型原核生物启动子、提高靶基因的高效表达及优化代谢途径提供思路。

    2024年06期 v.43 943-957页 [查看摘要][在线阅读][下载 2523K]
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  • 冠心病相关基因研究进展

    孙培雪;阮钰文;罗春艳;

    冠心病(coronary heart disease, CHD)是世界范围内致死率和致残率居首位的复杂性疾病。大量研究表明,冠心病是多个基因协同作用的,由遗传因素、环境因素或二者共同引发的表型呈间断分布的复杂性疾病。遗传因素显著影响冠心病的发生发展,其病理分子机制复杂,因此,对于冠心病易感基因的研究已经成为了深入了解冠心病发病机制的重要途径。本文综述了冠心病相关易感基因雄激素依赖性TFPI调节蛋白(androgen-dependent TFPI regulating protein,ADTRP)、载脂蛋白(apolipoprotein,Apo)基因家族、脂肪因子、炎症细胞因子等与冠心病发病机制之间的关联性。

    2024年06期 v.43 958-966页 [查看摘要][在线阅读][下载 1769K]
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  • 微RNA在恶性胸膜间皮瘤发生发展中的作用机制研究进展

    赵丹;普元倩;熊伟;

    微RNA(microRNA, miRNA)是近年来发现的最短的内源性非编码RNA(non-coding RNAs, ncRNA)之一,普遍认为其通过调节信使RNA(messenger RNA, mRNA)表达水平来发挥作用,主要功能体现在参与调节生物个体发育、细胞增殖与分化、肿瘤的发生发展等多种病理和生理过程中。miRNA在调控癌基因、抑癌基因的表达和信号通路的活性过程中以及在恶性胸膜间皮瘤(malignant pleural mesothelioma, MPM)发生和发展中发挥着重要的作用。本综述对miRNA的生成和miRNA的功能及在MPM发生发展过程中发挥促癌作用和肿瘤抑制作用的相关miRNA进行总结和归纳,以期为MPM的临床诊断以及治疗提供理论参考。

    2024年06期 v.43 967-975页 [查看摘要][在线阅读][下载 1300K]
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研究论文

  • 基于PEG-6000模拟干旱胁迫下三个甘蔗品种种茎根芽萌发特征

    黄霄宇;李文燕;安朋红;李文兰;陈保善;

    为探究三个抗旱性不同的甘蔗品种[‘中蔗9号’(ZZ9),抗旱性强;‘中蔗2号’(ZZ2),抗旱性弱;‘新台糖22号’(Xintaitang22),抗旱性居中]在不同干旱胁迫环境下萌发早期种茎根和芽萌发的差异,试验采用水培法用不同浓度梯度PEG-6000[CK、 10%(w/v)和20%(w/v)]模拟干旱胁迫连续培养12 d后采集根系和芽的萌发数量、根和芽的生物量、根系的形态特征及生理指标数据。研究结果显示,抗旱性强的品种‘中蔗9号’根系的形态指标(根总长、根面积、根体积和根直径等)均显著高于‘中蔗2号’和‘新台糖22号’的。随着PEG-6000胁迫程度加深,‘中蔗2号’的根系脱落率显著高于‘中蔗9号’的,在高浓度PEG-6000(20%)胁迫下,随时间的延长‘中蔗2号’的根系数量急剧下降,而‘中蔗9号’的根系数量呈现上升趋势,说明‘中蔗9号’的根点在高浓度PEG-6000模拟干旱胁迫下仍能保持生活力,并从休眠状态复苏而继续萌发。‘中蔗9号’的根茎粗壮,根系生物量最多,芽体生物量最少,而‘中蔗2号’反之,根系生物量最少,芽体生物量最多。在高浓度PEG-6000胁迫下,‘中蔗2号’和‘新台糖22号’的SOD、 POD的酶活性均下降,而‘中蔗9号’的处于持续上升趋势,此时‘中蔗9号’根系的脯氨酸含量亦极显著(240%)上升。在PEG-6000模拟干旱胁迫下,甘蔗种茎根芽萌发的上述特征与大田抗旱表型观察结果相吻合。本研究结果为快速筛选抗旱甘蔗品种提供了参考依据。

    2024年06期 v.43 976-985页 [查看摘要][在线阅读][下载 2201K]
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  • 全基因组甲基化测序比对软件在植物数据分析中的性能评估

    徐子健;江祉依;王海峰;谢亮;

    DNA甲基化作为一种表观遗传修饰,在植物的生长、发育和逆境反应中发挥着至关重要的作用。全基因组重亚硫酸盐测序(whole genome bisulfite sequencing, WGBS)被认为是DNA甲基化研究的“金标准”,并且广泛应用于动植物的功能基因组研究。虽然目前针对WGBS已经开发了数种分析工具,但还没有全面评估这些工具在植物基因组中的分析效率。本研究通过分析拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa)和大豆(Glycine max)3种主要作物的DNA甲基化数据,对DNA甲基化的4个分析工具中常用的6种比对方法(BSMAP、Bismark-bwt2-e2e、Bismark-his2、Abismal、BSSeeker2-bwt2-e2e和BSSeeker2-bwt2-local)从运行效率、内存资源利用、比对质量和甲基化位点识别等方面进行了全面的性能评估。结果显示,与另外5种甲基化比对方法相比,虽然BSMAP运存较大,但是在运行速度上表现出较高的效率,尤其在处理大规模基因组数据时具有明显的优势。此外,BSMAP在比对质量和甲基化位点识别方面也展现出较高水平,保证了结果的准确性和可靠性。值得注意的是,研究认为在选择比对工具时,还需要根据实际计算资源、研究需求以及对运行速度和内存消耗的权衡来做出合适的决策。这项研究为从事植物领域DNA甲基化研究的科研人员提供了有益的分析指导,有助于提高研究效率和结果的可信度,对深入分析植物生物学中的DNA甲基化具有重要的科学意义。

    2024年06期 v.43 986-996页 [查看摘要][在线阅读][下载 3085K]
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  • 梅SDR基因家族的鉴定及在花开放阶段的表达分析

    李玉;贾浩田;耿晓云;任红茜;郝瑞杰;

    本文旨在探究梅(Prunus mume)短链脱氢酶/还原酶(short-chain dehydrogenase/reductase,SDR)基因家族的生物信息学特征以及在花开放阶段的表达模式。通过生物信息学方法,从梅全基因组中鉴定出159个PmSDR基因,并进行保守基序、染色体定位、共线性关系和顺式作用元件分析,结合梅不同开花时期、花器官的转录组数据以及荧光定量PCR技术探究了PmSDR基因家族的表达模式。结果表明,PmSDR基因家族可分为4种类型,同一亚家族成员在保守基序方面具有较高的相似性;PmSDR基因家族不均匀分布在8条染色体上,并且存在大量成簇分布;种间共线性分析发现,与杏(Prunus armeniaca)相比,梅与桃(Prunus persica)SDR基因家族的同源性更高;该家族基因在启动子区域存在大量与光响应、植物生长发育、激素调节以及逆境响应有关的顺式作用元件。表达模式分析发现,PmSDR基因家族在不同开花时期和花器官的表达水平有较大差异,选择在开花时期表达量明显上调或在花器官中具有高表达量的PmSDR114C1、PmSDR114C16、PmSDR108E3、PmSDR108E9、PmSDR108E16、PmSDR108E17和PmSDR108E19进行荧光定量PCR验证,结果表明PmSDR114C1、PmSDR114C16可能参与梅的花期调控,PmSDR108E3、PmSDR108E9、PmSDR108E16、PmSDR108E17和PmSDR108E19可能参与梅的花香物质合成。本研究为探析PmSDR基因的功能提供了理论依据与参考,也为探讨梅开花阶段的分子机制提供了研究依据。

    2024年06期 v.43 997-1009页 [查看摘要][在线阅读][下载 5531K]
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  • 基于杜洛克猪全基因组重测序的InDel分析及重要经济性状基因定位

    何健;郑伟杰;孙艳梅;张瑞琪;王素青;马亮亮;袁仁强;赵云翔;郭金彪;

    本研究利用选择信号分析方法在美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪中筛选与重要经济性状相关的候选基因。选取健康状态良好、饲养管理水平一致的成年美系杜洛克公猪33头、丹系杜洛克公猪11头,提取DNA并重测序,利用F_(st)&P_i的联合分析,保留候选区域,对注释基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,进一步筛选与重要经济性状相关的相关候选基因。美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪的全基因组重测序平均测序深度在13×以上,测序数据平均效率为99.82%, Q30平均值分别为91.91%、 91.93%, G+C含量分别在42.90%~43.83%和42.48%~43.55%,均表明本次测序数据质量较高。以5%为筛选阈值,关联F_(st)&P_i提取相关候选区域,采用选择性消除方法检测到相应的选择信号区域,美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪之间的F_(st)值为0.268,θ_π比值分别为0.495和-1.415,P_i值分别为4.206和3.506。在美系杜洛克猪的选择性消除分析中有557个受选择区域,注释到1 323个基因;丹系杜洛克猪的选择性消除分析中有207个受选择区域,注释到338个基因。GO分析和KEGG通路富集分析发现,在美系和丹系杜洛克群体中初步筛选到ERLIN2、TMCO2、PITX2、SORCS3和SUFU等5个与精子发生、脂肪形成、生殖功能等性状相关的候选基因。在美系杜洛克猪中筛选到ATP1B1、LAMA4、EP300、ELOVL3、ECHS1、THEME5、PIP5K1A、PPT1、UBQLN1、IL2、CNTFR、ITGA10、SEC24D、MAP3K5和HSP90B1等15个与肉质、脂肪合成与代谢、精子发生、生长发育、骨发生和饲料效率等性状相关的候选基因。在丹系杜洛克猪中筛选到PDIA3、CBLIN2、CYCS和CDH7等4个候选基因,分别与产奶量、肉质性状、骨骼肌、饲料效率相关;BMI1、LHX8、ELL3、CATSPER2和CSMD1等5个与繁殖性状相关的候选基因。本研究发现美系杜洛克猪群体和丹系杜洛克猪群体间存在较大的遗传分化,为进一步研究杜洛克公猪的遗传特性提供了基因组数据支撑。

    2024年06期 v.43 1010-1027页 [查看摘要][在线阅读][下载 4552K]
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  • 不同生长阶段伊拉兔骨骼肌转录组数据的挖掘分析

    吴倩雯;王露;王文佳;姬正伟;路宏朝;程佳;

    为了进一步挖掘伊拉兔骨骼肌转录组的数据,本研究运用生物信息学对3个生长阶段的伊拉兔腓肠肌转录组数据进行深入的综合分析。通过对可变剪切、新转录本及其转录因子的表达模式和分子功能进行可视化呈现,结果发现,在伊拉兔骨骼肌的生长过程中,外显子跳跃(skipping exon, SE)是最常见的剪切方式,发生可变剪切的基因主要富集于泛素化介导的蛋白水解过程。同时,挖掘出4个新转录本,其编号分别是Novel.10047、 Novel.13070、 Novel.16785和Novel.7389,均与骨骼肌的氧化-还原过程和线粒体功能相关。同属于zf-C2H2转录因子家族成员的转录因子PLAGL1、 KLF15、 IKZF2和ZNF566可能作为潜在靶点参与调控伊拉兔骨骼肌的生长过程。研究结果对伊拉兔基因组和转录组注释信息进行了补充,为进一步完善及解析伊拉兔骨骼肌生长过程中潜在的功能基因及作用提供了理论基础和依据。

    2024年06期 v.43 1028-1038页 [查看摘要][在线阅读][下载 2636K]
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  • 基于RNA-seq技术的不同发育期中华大蟾蜍耳后腺和腹皮转录组比较分析

    陈文潇;陈晶;郭媛媛;洪永健;胡晶红;张金;

    通过对中华大蟾蜍(Bufo bufo gargarizans)5个不同发育时期的耳后腺和腹皮进行转录组测序分析,挖掘参与毒素合成的关键因子,为深入研究毒素合成调控机理提供理论依据。分别取3月龄、 6月龄、 12月龄、 24月龄、 36月龄等5个发育时期的中华大蟾蜍耳后腺和腹皮进行转录组测序,利用GO和KEGG对差异表达基因功能进行分析,利用加权共表达网络分析筛选关键基因。将处于相同发育时期腹皮与耳后腺的转录组数据进行比较,分别筛选出3 053、 3 026、 1 516、 1 028和2 061个差异表达基因。由GO分类统计结果可知,差异表达基因在生物过程类别主要集中于细胞过程、单一生物体过程、代谢过程和生物调节;在分子功能类别主要富集于结合、催化活性等方面;在细胞组分类别主要聚集于细胞、细胞组分和细胞器。KEGG通路分析结果表明,差异表达基因在蟾蜍发育过程中参与多条通路,如酪氨酸代谢、过氧化物酶体和初级胆汁酸代谢等。将5个发育时期的共同差异表达基因进行比较,筛选出与类固醇代谢、初级胆汁酸代谢和过氧化物酶体相关的21个基因,利用加权共表达网络分析筛选出4个模块的6个关键基因。在不同发育时期中华大蟾蜍的腹皮与耳后腺差异表达基因中,大量代谢途径基因发生了富集,这些基因可能在调控耳后腺毒素合成中具有重要作用,为解析蟾蜍产毒分子机制奠定了基础。

    2024年06期 v.43 1039-1053页 [查看摘要][在线阅读][下载 5096K]
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  • 水牛泌乳期与干乳期差异血清生化指标及代谢物研究

    丁子旭;徐祎雪;冯彤;王艳;崔奎青;李志鹏;杨春艳;刘庆友;

    本研究旨在比较泌乳期与干乳期水牛(Bubalus bubalis)差异血清生化指标及差异血清代谢物的组成,探讨血清生化指标与代谢物的相互关联,进一步了解水牛营养代谢过程的调控机制。选取泌乳期(泌乳第100~200天)健康水牛9头和干乳期(停乳后第30~60天)健康水牛9头,每头牛采血清样本两份,一份用生化分析仪进行20项指标检测;另一份用超高效液相色谱-串联质谱法(ultra-high performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry, UPLC-MS/MS)检测分析水牛血清中内源性代谢物。在生化指标检测结果中,泌乳期的谷草转氨酶/谷丙转氨酶(P<0.05)、甘油三酯(P<0.01)显著低于干乳期的,说明水牛在泌乳期时对酯类物质的利用效率更高;而泌乳期的胆固醇(P<0.01)、低密度脂蛋白(P<0.01)、高密度脂蛋白(P<0.001)、尿素氮(P<0.01)、葡萄糖(P<0.01)和免疫球蛋白A(P<0.000 1)等指标显著高于干乳期的,说明泌乳期时水牛的物质代谢更高。对于血清代谢物进行分析得出共有183种代谢产物在2个时期中存在显著差异(P<0.05, VIP> 1),这些代谢产物共富集到8条显著不同的代谢途径,分别是D-谷氨酰胺和D-谷氨酸代谢,精氨酸和脯氨酸代谢,色氨酸代谢,卟啉和叶绿素代谢,甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢,组氨酸代谢,不饱和脂肪酸的生物合成,以及氮代谢(P<0.05)。这些结果说明在泌乳期时,水牛吸收的营养物质主要用于参与多种氨基酸的合成及脂肪酸的合成与利用。

    2024年06期 v.43 1054-1065页 [查看摘要][在线阅读][下载 3994K]
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  • 黄颈亚马逊鹦鹉线粒体基因组全序列分析及系统进化

    陈云霞;黄娅琳;侯森林;周用武;

    黄颈亚马逊鹦鹉(Amazona auropalliata)属于《濒危野生动植物种国际贸易公约》附录Ⅱ监管物种。为了更好地了解黄颈亚马逊鹦鹉的起源、进化以及在鹦形目中的系统发育地位,本研究使用一代直接测序法获得了黄颈亚马逊鹦鹉的线粒体基因组序列,全长18 679 bp,并针对全序列进行了结构分析。结果表明,黄颈亚马逊鹦鹉线粒体基因组中碱基含量具有明显的AT偏好性,包含13个蛋白编码基因、 22个tRNA编码基因和2个rRNA编码基因,除了nad6在L链上以外,其他的蛋白编码基因都在H链上。黄颈亚马逊鹦鹉线粒体基因组有基因重叠现象且排列紧密,重叠序列长度范围从1 bp到6 bp,总长度共17 bp,共计8处;基因间隔序列的长度范围从1 bp到40 bp,总长度共154 bp,共计24处,有7处基因排列无间隙。基于线粒体基因序列分析发现,除了tRNA中trnC、trnF、trnG和trnH缺少反密码子环,trnP和trnQ缺少TΨC环,trnL-Ⅰ、trnS-Ⅱ和trnW呈短棒状,其他tRNA具有经典的三叶草二级结构。采用最大似然法(maximum likelihood method, ML)和近邻相接法(neighbor-joining method, NJ)对40种鹦形目物种线粒体全基因组序列构建系统进化树,结果表明黄颈亚马逊鹦鹉与黄冠亚马逊鹦鹉(Amazona ochrocephala)的亲缘关系最近。

    2024年06期 v.43 1066-1077页 [查看摘要][在线阅读][下载 3321K]
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  • m~6A阅读蛋白IGF2BP1对食管鳞状细胞癌细胞生物学行为的影响及其机制探讨

    孙姗;潘英杰;谭劲松;杨航;彭利红;冯刚;刘康;宋桂芹;

    本研究旨在探讨胰岛素样生长因子-2 mRNA结合蛋白1(insulin like growth factor 2 mRNA binding protein 1, IGF2BP1)对食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)细胞体外功能的影响及其作用机制。利用TIMER2.0数据库、免疫组化及实时定量PCR(real-time quantitative PCR, RT-qPCR)分析IGF2BP1在ESCC组织和癌旁组织中的蛋白及mRNA水平。采用siRNA敲低IGF2BP1在KYSE30和TE-1细胞中的表达,利用CCK-8实验、平板集落形成实验、划痕愈合实验、 Transwell实验以及流式细胞术检测敲低IGF2BP1对细胞功能的影响。利用Western blot检测敲低IGF2BP1对上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)相关蛋白及PI3K/AKT通路磷酸化水平的影响。利用STRING、 GEPIA数据库筛选出与IGF2BPl蛋白互作的其余N~6-甲基腺嘌呤(N~6-methyladenosine, m~6A)甲基化酶并进行差异表达分析。通过RM2Target、 SRAMP数据库预测下游靶基因及其m~6A修饰位点。结果显示,IGF2BP1在ESCC组织和细胞中高表达(P<0.05或P<0.001);敲低IGF2BP1后KYSE30和TE-1细胞增殖、迁移和侵袭能力减弱(P<0.05或P<0.001),细胞凋亡增多(P<0.05或P<0.001),同时促进E-cadherin的表达(P<0.05或P<0.01),抑制N-cadherin、 Vimentin的表达(P<0.05或P<0.01)以及PI3K/AKT通路的磷酸化(P<0.05或P<0.01);锌指CCCH结构域蛋白13(zinc finger CCCH domain containing protein 13, ZC3H13)与IGF2BP1蛋白互作且在ESCC中的表达水平与IGF2BP1正相关;ZC3H13和IGF2BP1共同调控的潜在靶基因CNNM2、KIAA1549、SP3均具有高可信度的m~6A修饰位点。本研究提示,IGF2BP1可能通过m~6A依赖的方式与其余m~6A甲基化酶协调作用,激活PI3K/AKT通路的磷酸化而促进ESCC细胞的增殖、迁移、侵袭,抑制细胞凋亡,并促进EMT进程,发挥致癌作用。

    2024年06期 v.43 1078-1092页 [查看摘要][在线阅读][下载 5768K]
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  • 基于转录组学分析CD146在人类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞条件培养液状态下的EAhy.926细胞中的基因表达差异

    王澜;王子素;李培霆;曾家顺;

    黑色素瘤细胞黏附分子CD146作为一种新的内皮细胞标志物,其表达与肿瘤、自身免疫性疾病的进展密切相关。类风湿关节炎(rheumatoid arthritis, RA)是一种以对称性、慢性多关节炎症为特征表现的系统性自身免疫性疾病,滑膜血管翳作为RA的代表性病理产物在疾病的发生发展中起着重要作用。为了研究CD146分子在人类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞(human rheumatoid arthritis fibroblast like synovial cell, HFLS-RA)条件培养液状态下的人脐静脉内皮细胞株EAhy.926的基因表达差异及其影响机制,本研究通过慢病毒介导的RNA干扰技术抑制EAhy.926细胞中CD146的表达。培养并提取HFLS-RA上清液制备条件培养液。将转染后的EAhy.926细胞用HFLS-RA条件培养液培养24 h构建RA损伤模型,并对其进行转录组测序,筛选出差异表达基因(differentiallly expressed genes, DEGs),并通过GO、 KEGG通路分析,探索CD146调控的DEGs主要参与的相关信号通路及生物学过程。结果显示,与对照组细胞相比,HFLS-RA条件培养液状态下CD146敲低的EAhy.926细胞有341个DEGs,其中上调基因有173个,下调基因有168个;GO、 KEGG通路分析发现DEGs主要富集在Wnt信号通路、 PPAR信号通路、 TRP通道的炎症介质调节、脂肪细胞因子信号通路上,参与了细胞黏附、细胞运动、细胞定位、半胱氨酸生物合成过程等生物过程。本研究通过转录组学分析发现在HFLS-RA条件培养液状态下,CD146分子可能通过多条关键信号通路及多个基因影响EAhy.926。研究结果为探讨CD146分子在类风湿关节炎滑膜血管生成中的作用及机制的研究提供了理论依据。

    2024年06期 v.43 1093-1110页 [查看摘要][在线阅读][下载 5579K]
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  • 基于生物信息学探讨非酒精性脂肪性肝炎铜死亡相关基因及中药预测

    高松林;张鹏;梁馨允;梁菲;管晓;温文建;唐嘉扬;黄贵华;

    本研究旨在运用生物信息学方法筛选非酒精性脂肪性肝炎(non-alcoholic steatohepatitis, NASH)的铜死亡相关基因和诊断性生物标志物,并预测调控铜死亡基因治疗NASH的潜在中药。从GEO数据库获取GSE89632数据集作为训练数据集,提取NASH中差异表达的铜死亡基因(differentially expressed cuproptosis-related genes, DECRGs),运用R4.2.2软件对DECRGs进行相关性分析和富集分析。基于DECRGs对NASH患者进行聚类分型,构建机器学习模型,筛选关键基因并验证。通过COREMINE数据库预测调控铜死亡基因治疗NASH的潜在中药,运用中医传承计算平台(Traditional Chinese Medicine Inheritance Computer System)v3.5软件挖掘用药规律。筛选得到9个DECRGs, DECRGs间存在相互调控的作用,富集分析发现DECRGs主要介导硫辛酸代谢、碳代谢、三羧酸循环等途径干预NASH。共识聚类将NASH患者分为3个亚型;支持向量机模型(support vector machine, SVM)为最合适的机器学习模型;NFE2L2、LIAS、GLS和GCSH和PDHB等5个与NASH最相关的铜死亡基因可作为NASH的诊断性生物标志物。在调控铜死亡基因治疗NASH的中药中,四气以寒、温、平为主,五味以苦、甘、辛味为主,主归肝、脾经,功效方面以补虚、清热、活血化瘀为主。本研究发现了NASH的铜死亡相关基因、诊断性生物标志物及对应中药的用药规律,可为中医药治疗NASH的临床应用和新药研发提供思路。

    2024年06期 v.43 1111-1120页 [查看摘要][在线阅读][下载 2373K]
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  • 基因组学与应用生物学 作者投稿指南

    <正>1刊登范围本刊主要刊登植物、动物和微生物基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等组学,分子医学、现代生物技术等应用生物学研究的未发表的创新性研究成果,以及上述领域的综述论文。2栏目设置本刊设置固定栏目和随机栏目。固定栏目常设研究论文,发表最新的原始研究成果。随机栏目根据稿源设述评及其他栏目。

    2024年06期 v.43 1121-1122页 [查看摘要][在线阅读][下载 690K]
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  • 基因组学与应用生物学 论文撰写指南

    <正>一、栏目设置本刊设置固定栏目和随机栏目。固定栏目常设研究论文,发表最新的原始研究成果。随机栏目根据稿源设述评及其他栏目。二、论文写作的基本要求1题目与标题论文题目要紧扣主题,务求简明、新颖,有足够的信息,能引起读者的兴趣,不用副标题,一般不宜超过25个汉字或英文单词。应使用标准术语、学名全称、药物和化学品通用名称,不宜使用广义术语、夸张词语等,同时避免在题目中使用不常用的缩写词。

    2024年06期 v.43 1123-1124页 [查看摘要][在线阅读][下载 740K]
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