- 冯维;林凯;王建忠;马忠才;吴雯霏;李霞;徐增富;
为了建立重要人工林树种桉树(Eucalyptus spp.)的稳定遗传转化体系,本研究采用发根农杆菌(Agrobacterium rhizogenes)介导的遗传转化方法,探索从转基因毛状根获得转基因再生植株,尝试建立我国桉树主栽无性系尾巨桉(Eucalyptus urophylla×E. grandis)DH32-29的转基因技术。首先分析了不同浓度的吲哚丁酸(indole-3-butyric acid, IBA)对DH32-29转基因毛状根诱导效率的影响以及外源基因小桐子(Jatropha curcas)成花素JcFT在转基因毛状根中的表达水平;进一步对比了不同浓度的新型化学诱导物非哌西特(fipexide, FPX)诱导转基因毛状根产生愈伤组织的效率。研究结果表明:利用发根农杆菌K599菌株侵染后的DH32-29在IBA诱导下可获得超量表达红色荧光蛋白报告基因DsRed2的转基因毛状根,并且转基因毛状根在含有FPX的培养基中进一步形成愈伤组织。转基因愈伤组织在不同的芽诱导培养基中分化出了再生根和叶绿组织细胞。本研究为进一步建立桉树的稳定遗传转化体系奠定了基础。
2025年05期 v.44 429-442页 [查看摘要][在线阅读][下载 1833K] [下载次数：119 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：1 ] - 唐茜;聂奕;王文慧;陈雨晴;魏济帆;黄予;陈怡君;刘柯颍;蔡文国;
内含子剪切是真核生物转录后修饰重要环节,是重要的基因表达调控方式。植物中多数基因存在可变剪切,能形成不同的剪切形式。然而对植物可变剪切因子的研究尚待深入。在本文的报告系统中,编码绿色荧光蛋白的基因中间插入了一个含有终止密码子的内含子以中断荧光蛋白的表达,而当内含子被正确剪切时能表达出绿色荧光蛋白。通过在本氏烟草(Nicotiana benthamiana)中进行瞬时表达实验,该系统可对植物可变剪切的效率进行定性与定量评估。此报告系统的建立为研究剪切辅助因子与特定前体mRNA的直接调控关系提供了新工具,同时也为快速筛选和研究剪切因子修饰对剪切过程的影响提供了便捷手段,有望进一步深化对可变剪切因子的认识。
2025年05期 v.44 443-454页 [查看摘要][在线阅读][下载 2656K] [下载次数：217 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：1 ] - 黄洁怡;韦璇;邓子秋;唐敏;兰弋;韦敏益;刘芳;
由革兰氏阴性菌黄单胞杆菌的致病变种(Xanthomonas oryzae pv.oryzicola, Xoc)引起的水稻细菌性条斑病(bacterial leaf streak, BLS),简称细条病,是国际上重要的检疫性病害之一。有效利用野生稻(Oryza rufipogon Griff.)抗细条病基因进行抗病品种培育可以从源头解决细条病防治问题。bls2是从广西普通野生稻中鉴定的一个对细条病具有广谱抗性的基因,但是其抗病机制尚不清楚。本研究通过代谢组学分析抗病近等基因系‘9311-bls2’及其轮回亲本‘9311’响应细条病菌侵染的抗性机制。结果发现,两份材料在接种细条病菌后48 h,上调的差异代谢物均明显多于下调的差异代谢物,表明水稻可能主要通过促进代谢物的合成来响应细条病菌的侵染。在‘9311’中上调的差异代谢物主要为萜类化合物、类固醇和类固醇衍生物、吲哚及其衍生物;而在‘9311-bls2’中上调的差异代谢物主要为萜类化合物、酚酸及其衍生物、类固醇和类固醇衍生物。此外, KEGG富集分析表明,‘9311’和‘9311-bls2’在细条病菌侵染后,差异代谢物共同显著富集于植物激素信号转导、二萜生物合成和色氨酸代谢途径。而α-亚麻酸代谢、多种植物次生代谢产物的生物合成,以及苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成途径则是‘9311-bls2’特有的显著代谢通路。茉莉酸、赤霉素、肉桂酸、二氢人参二醇、邻氨基苯甲酸、对香豆酰胍丁胺等代谢物在‘9311-bls2’中含量显著上调,可能在抵御细条病菌侵染中起到了关键作用。本研究为揭示抗细条病基因bls2的抗性机制提供一定的参考。
2025年05期 v.44 455-470页 [查看摘要][在线阅读][下载 4500K] [下载次数：54 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：1 ] - 马淑兄;贾春艳;王璐;霍柯帆;陈艳霞;李瑾;祁洪芳;刘扬;金文杰;
低氧是鱼类在水体环境中生存时经常面对的问题之一,其对鱼体免疫调节能力有至关重要的影响。为探究低氧胁迫对青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)免疫调节能力的影响,本研究以转录组学分析为基础,探讨低氧胁迫下鳃组织中免疫相关基因的表达情况。选取1龄期的青海湖裸鲤,低氧胁迫0、 30、 40和50 min后,取鳃组织进行转录组测序分析。对比分析空白对照组与3个低氧胁迫组之间基因的差异表达,并进行GO功能注释,发现免疫相关基因如ccl4、 ccl19、 MCP-1、ccl20、 sting1、 cxcl10、 tnfsf11、 ccl36.1、 il-8、 MHCⅠ(class Ⅰ major histocompatibility complex)和MHC Ⅱ(class Ⅱ major histocompatibility complex)的表达均上调,并且多数促炎性细胞因子与MHC类分子之间呈现正相关关系。表明低氧胁迫会使青海湖裸鲤特定基因表达上调,激活先天性免疫系统,引发MHC基因表达上调,启动特异性免疫反应和消除炎症,以协助机体恢复正常状态。
2025年05期 v.44 471-487页 [查看摘要][在线阅读][下载 5219K] [下载次数：150 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：1 ] - 苏美珍;易丹丹;韦信贤;雷爱莹;杨彦豪;童桂香;覃幼洁;谭红连;何鑫;李莉萍;
本研究旨在探讨无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)母源毒株HN016与弱毒株YM001对罗非鱼血液代谢组的影响,以期为无乳链球菌感染机制及弱毒株YM001疫苗免疫机制的研究提供理论基础。运用液相色谱-串联质谱技术(liquid chromatography-tandem mass spectrometry, LC-MS/MS)测定罗非鱼(Oreochromis niloticus)血液中的代谢物,并通过主成分分析(principal component analysis, PCA)和偏最小乘判别分析(partial least squares discriminant analysis, PLS-DA)、 KEGG通路、人类代谢数据库(human metabolome database, HMDB)分类及代谢物差异分析对母源毒株HN016组与弱毒株YM001组代谢物进行研究。研究结果表明母源毒株HN016组与弱毒株YM001组代谢物差异较大。其中PCA与PLS-DA结果显示母源毒株HN016与弱毒株YM001组、对照组相比,样本间的聚集程度较小,弱毒株YM001组与对照组样本间聚集程度相似; KEGG通路结果显示ABC转运器、精氨酸和脯氨酸代谢通路被极显著富集,且含代谢产物数量最多; HMDB化合物分类上超类、层及子类层级分为10、 34、 55个类别,有机酸及其衍生物类别包含63种代谢物,数量最多;代谢物差异分析结果表明母源毒株HN016组相较于弱毒株YM001组共有133种代谢物上调, 88种代谢物下调,母源毒株HN016组中的亚精胺、核黄素、辛二酰甘氨酸等代谢物极显著低于弱毒株YM001组,环状RGD肽、 2-羟基喹啉、除莠霉素A等代谢物极显著高于弱毒株YM001组;母源毒株HN016组中的DL-二氢鞘氨醇、 4-三甲基氨基丁酸、 L-4-羟基谷氨酸半醛、(S)-3,4-二羟基丁酸及β-亮氨酸等代谢物丰度低于对照组与弱毒株YM001组,(1R,2R,4S)-对薄荷烷-1,2,8-三醇、棕榈酰肉碱、溶血磷脂酸、 O-己二酰肉碱、溶血磷脂酰乙醇胺等代谢物丰度高于对照组与弱毒株YM001组。这些代谢物的变化不仅揭示了两种菌株感染后罗非鱼血液代谢组的差异,还为进一步理解无乳链球菌感染机制及弱毒株YM001的潜在免疫保护作用提供了重要线索。对于开发针对无乳链球菌感染的新型疫苗和治疗策略具有重要意义。
2025年05期 v.44 488-500页 [查看摘要][在线阅读][下载 1921K] [下载次数：109 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：1 ] - 冯真;薛慧铭;金畅;张月;郑梅竹;
为阐明芍药苷(peoniflorin, PF)抗帕金森病(Parkinson's disease, PD)的具体靶点和信号通路,本研究通过MPP~+诱导损伤的PC12细胞模型,结合蛋白质组学分析芍药苷对PC12损伤细胞的保护作用及其潜在靶点和机制。细胞实验结果表明,经芍药苷处理的细胞组与MPP~+诱导损伤的模型组相比,芍药苷能显著提高MPP~+诱导损伤PC12细胞的存活率,对其有显著的保护作用。通过蛋白质组学分析,共鉴定到5 525个含有定量信息的蛋白;对不同组别的差异蛋白进行两两比较,发现共有77个差异蛋白(除未知蛋白)共同存在于模型vs细胞组及药物vs模型组中。在蛋白质组学研究中, KEGG信号通路分析揭示了PI3K-AKT信号通路发生了显著变化。在此基础上,运用蛋白质免疫印迹(Western blot)对信号通路中的关键蛋白进行了验证,结果显示,与MPP~+诱导损伤后的模型组相比,通路中关键蛋白BDNF、 PI3K、 AKT和CREB的表达水平显著上升。芍药苷可能通过活化BDNF/PI3K/AKT/CREB信号通路减轻MPP~+诱导的PC12细胞损伤的作用。本研究为进一步深入研究芍药苷抗帕金森病的作用靶点和机制提供理论基础。
2025年05期 v.44 501-510页 [查看摘要][在线阅读][下载 1916K] [下载次数：354 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：1 ] - 林洪升;谭金娜;方巧玲;杜柯薇;何佳倩;王运踊;鲁晓航;潘爱萍;李明芬;
本研究主要探讨环状RNA(circular RNA, circRNA)在鳖甲煎丸抑制肝癌进展过程中的表达变化及分子机制。利用find＿circ和CIRI算法、 KEGG通路和GSEA富集分析,对circRNA的表达及特征进行深入研究。采用彗星实验检测鳖甲煎丸含药血清对肝癌细胞DNA损伤的影响;通过β-半乳糖苷酶染色评估其对肝癌细胞衰老的诱导作用;采用划痕实验检测细胞迁移能力的变化。此外,还构建了肝癌细胞皮下移植动物模型,并观察了瘤体体积和生长曲线的变化。共鉴定出1 764个差异表达的circRNA,其靶基因主要富集于自噬-动物、脊髓小脑共济失调、内质网中的蛋白质加工和细胞衰老等信号通路。GSEA分析进一步显示,这些circRNA的靶基因在UV响应DN、有丝分裂纺锤体和G2M检查点通路中显著富集。彗星实验结果表明,鳖甲煎丸含药血清可显著诱导肝癌细胞的DNA损伤(P<0.01); β-半乳糖苷酶染色实验显示,经干预后的衰老肝癌细胞数量显著增加(P<0.001)。划痕实验结果表明,经干预后的肝癌细胞迁移能力在48 h时被显著抑制(P<0.000 1)。小鼠皮下瘤模型实验结果显示,经鳖甲煎丸灌胃后的肿瘤体积明显减小,生长曲线显著降低(P<0.000 1)。综合以上结果,鳖甲煎丸通过调控circRNA的表达、诱导肝癌细胞的衰老进而抑制肝癌细胞的迁移和增殖以发挥抗肝癌作用。
2025年05期 v.44 511-519页 [查看摘要][在线阅读][下载 2298K] [下载次数：177 ] |[引用频次：0 ] |[阅读次数：1 ]