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甘蓝型油菜BnaLPAT2基因克隆与生物信息学分析及载体构建
汪慧慧;刘少锋;岳宁燕;熊兴华;为进一步研究甘蓝型油菜BnaLPAT2基因,通过TAIR网站查找拟南芥AtLPAT2 (AT3G57650),在Brassica Database数据库检索到4条甘蓝型油菜LPAT2序列,据此设计引物,通过RT-PCR合成c DNA,得到4条CDS序列,其大小依次为1 173 bp、1 167 bp、1 173 bp、1 155 bp,分别命名为BnaLPAT2-1～BnaLPAT2-4。4个BnaLPAT2蛋白通过生物信息学预测分析显示:BnaLPAT2编码的氨基酸在384～390之间,理论分子量介于43 226.59～43 730.17 Da之间。甘蓝型油菜LPAT2蛋白的二级结构和跨膜区大致相同,均由LPLAT superfamily、PlsC superfamily、AcyltransfC superfamily结构域组成,且具有较近的亲缘关系。从基因结构发现:4个BnaLPAT2均含有相同的外显子和内含子数,分别位于C08、A09、A07和A04染色体上。分析表明,克隆获得的4个甘蓝型油菜BnaLPAT2为该基因家族成员。为进一步研究甘蓝型油菜LPAT2基因的功能,我们通过双酶切技术,构建pBI121-LPAT2-napin载体,并转化根癌农杆菌GV3101。
我国天牛种群生态学研究进展
陆温,田明义,韦绥概,覃爱枝天牛是鞘翅目中为害林木、园林绿化树木和果树的一类重要钻蛀性害虫。从天牛种类与为害、迁移与扩散、种群动态与环境的关系、种群空间格局与抽样技术以及自然种群生命表及应用等方面系统地评述了我国天牛类害虫的种群生态学研究进展,并提出研究中存在的问题及展望。
磷酸奥司他韦对人体肠道菌群的体外影响
赵昌会;陈华海;胡云霏;李百元;曹林艳;蒋琼凤;尹业师;磷酸奥司他韦(oseltamivir phosphate, OP)是治疗甲型和乙型病毒性感冒的特效药。本文通过宏基因组测序、气相色谱和高效液相色谱技术，研究磷酸奥司他韦对人体肠道微生物群落的体外影响，为磷酸奥司他韦的临床应用提供肠道菌群方面的数据支持。研究结果显示，磷酸奥司他韦显著降低拟杆菌科(Bacteroidaceae)、丙酸蛛网菌(Arachnia propionica)、子囊菌门(Ascomycota)和微小噬菌体科(Microviridae)的相对丰度，显著提高多动物链球菌(Streptococcus pluranimalium)、苏黎世克罗诺杆菌(Cronobacter turicensis)和担子菌门(Basidiomycota)的相对丰度(P<0.05)。另外，磷酸奥司他韦对新月形单胞菌科(Selenomonadaceae)、乳酸菌科(Lactobacillaceae)、普雷沃菌科(Prevotellaceae)、单形巨单胞菌(Megamonas funiformis)、黏膜乳杆菌(Limosilactobacillus mucosae)、粪源普雷沃氏菌(Prevotella copri)和青春双歧杆菌(Bifidobacterium adolescentis)的相对丰度有一定影响，对代谢通路和短链脂肪酸(short-chain fatty acids, SCFAs)的影响不明显。在功能基因方面，磷酸奥司他韦仅显著影响异柠檬酸脱氢酶、 D-氨酰-tRNA脱酰基酶和7-羧基-7-去氮嘌呤合酶的基因丰度(P<0.05)。肠道菌群对磷酸奥司他韦降解的个体性差异较大，各组磷酸奥司他韦的平均降解率在8.6%～88.4%。总之，磷酸奥司他韦在体外发酵过程中对人体肠道菌群结构、代谢通路及其代谢产物等的影响较小。
天然植物提取物甜菊苷和甜菊苷A在动物营养中的应用
许丽卫;张丽萍;王久荣;韩雪峰;随着生活水平的日益提高,人们对畜产品的需求量也在不断的扩大。因此开发研究天然植物添加剂可以改善饲料品质或者适口性,从而提高动物的采食或对饲料的利用率,获得较高的养殖效益。甜菊苷(Stevioside)和甜菊苷A(又称莱苞迪苷A,Rebaudioside A)是两种新型的天然高倍非营养型甜味剂,作为动物饲料添加剂发展潜力巨大。本研究就甜菊苷和甜菊苷A的性质、提取分离和定性定量分析方法及其在动物生产中的应用进行了综述,旨在探索发掘天然植物提取物,使饲料添加剂的来源更加绿色、高效,最终推动畜牧业更好地发展。
木薯SWEETs基因家族生物信息学及表达特性研究
薛蓓蓓;覃丽芳;董明右;李有志;樊宪伟;SWEET (sugars will eventually be exported transporters)是植物中新发现的一类编码糖转运蛋白的基因,它在植物生长发育及糖代谢过程中发挥重要作用。该基因家族在木薯(Manihot esculenta)中尚未有详细的报道。本研究从Phytozome数据库获得了28个木薯SWEET候选基因并对其进行生物信息学分析,在华南124的木薯苗中通过荧光定量实验检测SWEET基因在旱胁迫下的表达水平。结果发现木薯SWEET基因被分为4簇,主要分布在第6条和第14条染色体上,编码234 aa与302 aa之间的氨基酸序列;木薯SWEET基因家族的表达在旱胁迫条件下发生了变化,其中明显上调的基因有9个,包括MeSWEET1b、MeSWEET2a、MeSWEET6、MeSWEET9a、MeSWEET9b、MeSWEET12、MeSWEET15a、MeSWEET15b和MeSWEET16c;而表达量明显下调的基因也有9个,为MeSWEET2b、MeSWEET3b、MeSWEET4、MeSWEET7、MeSWEET11、MeSWEET16a、MeSWEET16b、MeSWEET17a和MeSWEET17c。这些结果为进一步阐明SWEET基因家族在木薯中的功能提供理论依据。
四川邛海湖湿地鸟类种群多样性及邛海湖生态评价
李海涛;黄渝;本研究采用定点取样,统计与分析采集数据,于1988年、1999年及2006年冬季至2007年春先后对四川西昌邛海湖及其湖周湿地进行实地考察,对湖区鸟类进行调查统计,记录鸟类25种,隶属6目6科,该湿地鸟类的多样性变化较为明显,物种稳定性差,这表明邛海湖湿地鸟类的生存状况不容乐观。随着经济的发展和人类活动的加剧,邛海湿地遭受不同程度的破坏,导致湿地不断萎缩退化,环境功能与生物多样性逐渐衰减,邛海湿地的生态环境状况需进一步的研究和保护。
产褐藻胶裂解酶交替单胞菌的发酵优化及alg2951的外源表达
李双;王碧盈;鲍时翔;刘敏;胡永华;孙冬梅;黄惠琴;褐藻胶裂解酶是制备生物活性寡糖的重要功能酶,在食品、农业、工业等行业中具有重要应用价值。本研究以交替单胞菌属新种HB161718为出发菌株,在单因素实验基础上,通过Box-Behnken设计及响应面法优化获得该菌的最佳产酶培养基:海藻酸钠7.23 g/L,蛋白胨7 g/L,NaCl 23.11 g/L,K_2HPO_40.1 g/L,MgSO_40.1 g/L,优化条件下酶活力为(54.28±3.47) U/mL,达到优化前的1.59倍。为进一步提高酶活性,通过分子生物学方法实现了褐藻胶裂解酶alg2951在大肠杆菌中的外源表达,纯化后的酶活性为636 U/mL,达到原始菌株酶活的18.6倍。本研究为褐藻胶裂解酶的工业生产提供了新的来源。
抗体检测胶体金免疫层析技术中不同拦截模式的初步比较研究
卞宇晨;田广原;王宇琛;于佳梁;周雅坪;郭婷;赵红梅;赵逢淼;孙雅婕;周雨霞;胶体金免疫层析技术是以胶体金作为示踪标志物，应用于抗原抗体反应中的一种新型快速检测技术，目前国内外对于抗体检测胶体金免疫层析技术中不同拦截模式的比较研究较少。本研究将牛传染性鼻气管炎病毒(infectious bovine rhinotracheitis virus,IBRV)的gD基因进行了原核表达，以纯化的IBRV gD-pAb作为检测靶标，将胶体金标记的g D蛋白、金黄色葡萄球菌蛋白A(staphylococcal protein A,SPA)、链球菌蛋白G(streptococcal protein G,SPG)、羊抗兔IgG分别包被于金垫，将未标记的上述4种蛋白分别包被于NC膜的检测线处，将金垫和NC膜进行组合，制备出7种抗体拦截模式的胶体金免疫层析试纸，通过比较其灵敏度、显色效果及批内重复性来评价不同拦截模式的实际性能。结果显示，标记抗原-SPG、标记抗原-SPA、标记抗原-二抗拦截模式(间接法)的灵敏度约为标记抗原-抗原拦截模式(双抗原夹心法)的200倍；间接法中标记抗原-SPG、标记抗原-SPA与标记SPG-抗原、标记二抗-抗原拦截模式的灵敏度相近，而标记抗原-二抗拦截模式及标记SPA-抗原拦截模式由于IgG结合蛋白的特性而导致试纸的灵敏度降低、显色效果及批内重复性变差；7种抗体拦截模式试纸在检测副结核分枝杆菌(Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis,MAP)、赤羽病病毒(akabane virus,AKAV)、牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)、牛支原体(Mycoplasma bovis)、小反刍兽疫病毒(peste des petits ruminants virus,PPRV)、布氏杆菌(Brucella)、口蹄疫病毒(foot-and-mouth disease virus,FMDV)的标准阳性血清时均为阴性反应；IgG结合蛋白的实际性能排序为SPG>SPA>二抗。本研究为其他疫病抗体检测的胶体金免疫层析试纸的制备提供参考。
6-BA对喜树的组织培养和喜树碱合成的影响
吕莹;宋婷;李琳;于放;刘志文;喜树(Camptotheca acuminata Decne)是一种具有药用价值的木本植物，其主要次级代谢产物喜树碱具有良好的抗癌功效。野生喜树资源有限。为合理开发利用资源，可通过组织培养技术快速繁殖种苗。本研究以喜树组培苗和愈伤组织为研究对象，在木本植物培养基(woody plant medium, WPM)中添加不同浓度(0, 0.05, 0.1, 0.5, 1 mg/L)的6-苄氨基嘌呤(6-benzylaminopurine, 6-BA)，探究其对喜树组织培养、喜树碱合成和基因表达的影响。结果表明：低浓度(<0.1 mg/L)的外源6-BA有利于喜树组培苗生长，高浓度(>0.5 mg/L)的外源6-BA不利于生根但有利于诱导丛生芽和提高快繁系数。6-BA对喜树组培苗不同器官和组织中的喜树碱均有较好的促进作用，且呈现先增后减趋势，主要是通过促进叶片中CaG8O、茎中CaSTR、根中CaTDC1和愈伤组织中CaSTR和Ca7DLS的表达量来促进喜树碱的合成。6-BA在喜树组织培养过程中表现出多重和矛盾的作用，因此可根据组织培养目的不同，选用不同浓度的6-BA处理喜树组培苗，以达到预期的效果。本研究为应用喜树组织培养技术和促进喜树碱的合成提供了理论依据。