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期刊简介
《基因组学与应用生物学》(ISSN1674-568X，CN45-1369/Q)是由广西大学主管和主办，国内外公开发行的科技期刊（月刊），为北京大学图书馆《中文核心期刊要目总览》入编期刊、中国科学引文数据库（CSCD）来源期刊、科技期刊世界影响力指数（WJCI)报告来源期刊和中国科技核心期刊（中国科技论文统计源期刊）。
《基因组学与应用生物学》主要刊登植物、动物和微生物基因组学、转录组学、蛋白组学和代谢组学等组学，分子医学、现代生物技术等应用生物学研究的未发表的创新性研究成果，以及上述领域的综述论文。
PBX1生物学功能研究进展
李雯;王培昌;宋乔;前B细胞白血病同源盒转录因子1(pre-B-cell leukemia homeobox transcription factor 1, PBX1)是一种在进化上高度保守的同源结构域蛋白，在细胞代谢、组织和器官的发育及分化等多个胚胎发育过程中发挥关键作用。PBX1作为一种“先锋转录因子”,可以增加染色质可及性，激活并促进骨骼肌分化和乳腺癌增殖相关靶基因的转录。PBX1缺失会影响胚胎时期多种器官的正常发育，使器官形态和功能出现异常，导致各类先天疾病。PBX1也与多种癌细胞的增殖、侵袭和上皮间充质转化相关，且在多种癌症中发挥促癌作用。本综述通过详细阐述PBX1的结构、功能及其在多种疾病中的致病机制，为PBX1的相关研究提供参考。
骨钙素在考古学研究中的应用
袁梦;凌雪;赵丛苍;骨钙素(osteocalcin, OC)是一种由成熟成骨细胞分泌的维生素K依赖性钙结合蛋白，作为骨骼中含量最多的非胶原蛋白，它被认为是骨形成和骨转换的重要标志。由于骨钙素在骨骼中的高稳定性和低污染风险，其在考古学研究中显示出极大的应用前景。然而，国内对于骨钙素的考古学研究尚显不足。本文系统梳理了骨钙素的生物学特性，揭示了其在考古学领域中判断个体年龄段和性别、获取准确的碳氮同位素数据、分析先民的生存压力和疾病状况、建立系统发育关系等方面的巨大潜力。在此基础上，深入分析了骨钙素未来研究趋势，以期为骨钙素在中国考古学领域的进一步应用提供新视角和方法。
杉木ClMYB5基因cDNA的克隆、表达特性与互作蛋白研究
李翠萍;张子健;文娅婷;徐增富;李魁鹏;杉木(Cunninghamia lanceolata)是我国南方主要的用材树种，具有广泛的用途。MYB转录因子家族在植物的生长、发育、非生物胁迫应答以及类黄酮生物合成等方面起到重要的调控作用。本研究克隆了与拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtMYB5基因同源的杉木ClMYB5基因cDNA,对其进行生物信息学、表达特性及互作蛋白分析。生物信息学分析结果显示，ClMYB5蛋白为既亲水又亲脂蛋白，定位在细胞核中，有信号肽，无跨膜结构域，含有一个R2-R3结构域，属于R2R3-MYB转录因子亚家族；RT-PCR结果显示，ClMYB5在杉木根表达量最高，其次为树干木质部；酵母双杂交实验表明，ClMYB5与ClbHLH30蛋白存在相互作用。通过荧光素酶蛋白互补实验，进一步验证了ClMYB5与ClbHLH30存在互作关系。RT-PCR结果显示，ClbHLH30在形成层中表达量最高。综合实验结果表明，ClMYB5主要在杉木木质部维管组织中表达，在杉木类黄酮生物合成中可能具有潜在的调控功能。本研究增进了对裸子植物MYB转录因子家族成员作用的认知。
适应喀斯特与非喀斯特生境的两种天葵属植物的基因组特征研究
莫晓芫;张强;黄夕洋;吴磊;覃信梅;为探索适应不同生境基质植物基因组特征变异规律，本研究以生长在喀斯特石灰岩上特有种广西天葵(Semiaquilegia guangxiensis)和与之近缘且主要生长在泥土上的广布种天葵(Semiaquilegia adoxoides)为研究对象，利用流式细胞术和基于二代测序的基因组Survey分析，评估基因组大小、杂合率、重复序列、 GC含量和倍性，比较和分析基因组特征差异。流式细胞术预估广西天葵和天葵的基因组大小分别为392.12 Mb、 337.68 Mb。K-mer分析预估两者基因组大小分别为390.68 Mb、341.12 Mb,杂合率分别为0.54%、 0.08%,重复序列分别为52.40%、 47.70%,预测两者均为二倍体。基因组初步组装得到两者基因组大小分别为311.62 Mb、 264.24 Mb, GC含量分别为36.47%、 36.34%,经BUSCO评估组装完整性相对较好。以上结果表明，专性生长在喀斯特石灰岩的广西天葵的基因组大小、杂合度、重复序列均高于分布广泛的天葵。对基因组进行重复序列注释和功能分析显示，广西天葵的重复序列和转座子比例均比天葵高，广西天葵重复序列功能注释到了氧化还原、能量代谢、次生代谢物合成、调控Ca2+、细胞壁合成等条目，这可能与其适应喀斯特生境有关。本研究为天葵属植物的全基因组测序、组装和精细图谱绘制进而解析适应不同生境的分子机理奠定基础，也为资源保护和开发利用提供参考。
全基因组关联分析鉴定水稻中细菌性条斑病的抗性位点
杨梅;牛鹏威;陈美伶;陈福平;陈曼妮;岑卫健;罗继景;由革兰阴性菌水稻黄单胞菌(Xanthomonas Campestris pv.oryzae, Xoc)引起的细菌性条斑病(bacterial leaf streak, BLS)是水稻生产区最具破坏性的病害之一，尤其是在潮湿的热带、亚热带地区。本研究通过对152份不同水稻(Oryza sativa)种质进行细菌性条斑病的抗性表型鉴定，并结合SNP数据进行全基因组关联分析(genome-wide association analysis, GWAS),确定了分布于水稻1、 2、 5、 9和11号染色体上的46个数量性状位点(quantitative trait locus, QTL),其中有6个与已报道的位点共定位，2个为新的BLS抗性关联位点。本研究为挖掘水稻细条病抗性基因奠定了重要基础。
