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菹草提取物总黄酮、总酚酸和抗氧化活性含量研究
蔡荣荣;周卓达;柴倩倩;研究菹草提取物的有效成分,测定其总黄酮含量及总酚酸含量,并确定它的乙酸乙酯和石油醚部位的抗氧化活性成分。采用紫外可见分光光度法,以芦丁和没食子酸作为控制材料,测定菹草的石油醚部位及乙酸乙酯部位中总黄酮和总酚酸含量;采用清除DPPH自由基能力测定法、测定总还原能力铁氰化钾法和水杨酸捕捉羟基自由基法来对菹草各组分提取物的抗氧化能力进行研究。菹草中有一定量的黄酮类化合物和酚酸类化合物存在,不同溶剂提取的部位所含有的总黄酮和总酚酸含量是有差异的,石油醚部位的总黄酮含量要高于乙酸乙酯部位的总黄酮含量,并且总酚酸的含量亦是如此;石油醚部位和乙酸乙酯部位的提取物具有清除DPPH、羟基自由基和还原Fe3+的能力,各部位清除DPPH、羟基自由基的能力和还原Fe3+的能力随着样品浓度的增大而增大,且乙酸乙酯部位的测定结果均低于石油醚部位。
化合物药物-靶标蛋白互作关联预测算法进展分析
唐春艳;钟诚;李娜;钟铭;张行健;药物的使用极大地提高了人类的生存质量。药物的有效性是药物发现研究中的关键环节。药物的有效性通过识别药物与其作用的靶标蛋白来判断。然而,通过高通量筛选的实验方法分析确定化合物药物-靶标蛋白互作关联是一个十分昂贵、耗时且富有挑战性的任务。基于计算方法的化合物药物-靶标蛋白互作关联预测研究具有效率高、成本低的特点,越来越受到人们的重视。相比实验验证方法,化合物药物-靶标蛋白互作关联的计算方法可为药物发现研究后续的生物药学实验提供更为准确的潜在化合物药物-靶标蛋白候选对,达到减少生物实验的时间和成本的目的。本文回顾了近20年来基于计算方法的化合物药物-靶标蛋白互作关联预测算法所涉及的生物医学特征数据、预测方法和技术,并分析研究过程中所面临的生物医学特征数据高维稀疏,以及多源生物医学数据融合程度不高等问题,为进一步研究提供有价值的参考。
何首乌组培快速繁殖技术的研究
杨振德,何际选,黄寿先,周传明,卢天玲对何首乌的组培快繁技术进行了研究。结果表明 :采用 MS+6-BA1 .0 mg/L+IBA0 .1 mg/L的培养基能成功地诱导芽的分化。对于芽增殖 ,以 MS+6-BA 0 . 75 mg/L+IBA 0 .0 5 mg/L或MS+6-BA 1 .5 mg/L+IBA 0 .1 mg/L培养基较好 ,培养 3 0 d后芽增殖率可分别达到 3 .89和 4.1 1。诱导生根以 1 /2 MS+IBA 0 .5~ 1 .2 5 mg/L或 1 /2 MS+NAA 0 .5 mg/L培养基较好 ,培养 2 0 d后生根率可达80 .0 %~ 86.7%。
SESN3对糖尿病心肌病心脏纤维化的影响
熊志阳;黄妍;罗业;罗杨;阎韬;刘力辉;万居易;通过生物信息学方法及高糖处理原代心脏成纤维细胞后的Western blot分析应激诱导蛋白家族成员Sestrin3(SESN3)在糖尿病心肌病(diabetic cardiomyopathy, DCM)心脏纤维化疾病中的作用。对从GEO数据库搜索到的与DCM相关的四个数据集GSE26887、 GSE197999、 GSE161931和GSE5606进行基因差异表达分析,绘制差异表达火山图;利用韦恩图分析四个数据集共同差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),并对其进行功能富集分析;在原代大鼠(Rattus norregicus)心肌细胞中验证相关基因的表达情况。GO分析结果显示,在GSE26887、 GSE197999、 GSE161931和GSE5606数据集中共同上调或下调的DEGs主要富集于细胞器裂变、核分裂、细胞骨架运动活性等方面;SESN3在GSE26887数据集中显著上调。Western blot结果证实SESN3在高糖诱导的心脏成纤维细胞中呈现先上调后下调的趋势。本研究提示SESN3基因对DCM心脏纤维化可能具有保护作用。
抗阻运动对2型糖尿病大鼠模型血脂代谢和胰岛素抵抗的影响
金银哲;为了考察抗阻运动对2型糖尿病大鼠模型血脂代谢和胰岛素抵抗的影响。本研究将60只雄性SD大鼠随机分为对照组、模型组和抗阻运动组,通过高脂饮食和注射链脲佐菌素诱导2型糖尿病大鼠模型。采用全自动生化分析仪检测各组大鼠空腹血糖(FPG)、总胆固醇(TC)和甘油三酯(TG)水平。采用商用试剂盒检测低密度脂蛋白(LDL)、高密度脂蛋白(HDL)、胰岛素(INS)、瘦素(Lep)、超氧化物歧化酶(SOD)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)、丙二醛(MDA)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)和白细胞介素(IL-1和IL-6)水平。采用苏木精和伊红(HE)染色检测大鼠胰腺组织病变。采用蛋白质印迹分析检测葡萄糖转运蛋白(GLUT-4)和胰岛素受体底物-1 (IRS-1)的表达。研究显示,抗阻运动组大鼠的胰岛形态明显改善,结构较完整,边界变清晰,细胞空泡和脂滴沉积明显减少。抗阻运动组的空腹血糖水平显著低于模型组。抗阻运动组大鼠的TC、TG和LDL水平均显著低于模型组,而HDL水平显著高于模型组。抗阻运动组的INS和Lep水平显著低于模型组。抗阻运动组的SOD和GSH-Px水平显著高于模型组,而MDA水平显著低于模型组。抗阻运动组的TNF-α、IL-1和IL-6水平显著低于模型组。抗阻运动组的GLUT-4和IRS-1的蛋白表达水平显著高于模型组。本研究表明抗阻运动可有效改善2型糖尿病大鼠糖脂代谢并提高胰岛素敏感性。抗阻运动可能通过降低氧化应激损伤和炎症反应并上调胰腺组织GLUT-4和IRS-1的表达来发挥保护作用。
毛竹TCP基因家族全基因组鉴定与分析
刘俊;黄容;程占超;李雪平;TCP蛋白是植物特有的一类转录因子,在植物生长、发育、信号转导以及生理生化刺激响应等方面具有重要功能。毛竹(Phyllostachys edulis)是世界上生长速度最快的植物之一,在中国具有重要的经济、生态和社会价值。为了解TCP基因家族在毛竹基因组中的数量和表达,本研究利用生物信息学方法对毛竹TCP基因家族进行全面概述,包括基因结构、进化关系、保守结构域和表达模式等。结果显示,毛竹基因组中含有19个基因编码TCP转录因子,依次命名为Phe TCP1-Phe TCP19,蛋白质大小为100~406 aa,等电点为4.85~10.70,均是疏水性蛋白;PheTCPs基因结构较为简单,大部分不含内含子;发现所有PheTCPs转录因子具有高度保守的TCP结构域;19个PheTCPs隶属于2个组:ClassⅠ和ClassⅡ,ClassⅡ进一步划分为CIN、CYC/TB1两个亚类。表达模式分析表明,19个PheTCPs在毛竹不同笋和花发育时期中的表达差异明显。本研究为进一步探索毛竹TCP基因家族各成员的功能提供一定的理论基础。
夹脊穴电针降低带状疱疹神经痛患者的疼痛
高嘉彬;为了探究夹脊穴电针治疗带状疱疹神经痛的疗效及其可能的分子机制,本研究选取了80例带状疱疹神经痛患者,并随机将其分为观察组和对照组,每组各40例。观察组行夹脊穴电针为主的针刺治疗;对照组给予常规西药治疗,两组均以10 d为一个疗程。通过观察治疗前后两组的镇痛效果,抑郁状态改善效果及综合疗效,并进一步检测治疗前后IL-6、IL-8及TNF-α等炎性细胞因子水平,本研究发现治疗前两组的视觉模拟评分(VAS评分)、抑郁量表评分及血清IL-6、IL-8、TNF-α水平比较无统计学差异(p>0.05);治疗后两组的VAS评分、抑郁量表评分及血清IL-6、IL-8、TNF-α水平较治疗前显著降低,且治疗后观察组的VAS评分、抑郁量表评分及血清IL-6、IL-8、TNF-α水平显著低于对照组(p<0.05);观察组的综合临床疗效显著优于对照组(p<0.05)。本研究表明,夹脊穴电针可以显著减轻带状疱疹患者的疼痛程度,并能改善抑郁程度,综合疗效优于单纯西药治疗,其机制可能与减轻炎性反应有关。我们的研究为夹脊穴电针在带状疱疹神经痛的临床治疗和分子机制的研究提供了一定的依据。
利用PCR-DGGE分析有机物对厌氧氨氧化菌群的影响
刘凯;王凡;李祥;毕玮;刘恒蔚;黄勇;为了研究有机物对Anammox菌群的影响,以及微生物与脱氮的关系,为工艺改进提供依据。使用SBR厌氧氨氧化反应器,从反应器不同TOC/NH4~+-N阶段采集活性污泥样品,利用聚合酶链式反应—变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术,分析了样品中微生物种群结构。结果表明反应器中主要微生物包含变形菌门(Proteobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和绿菌门(Chlorobi);其中变形菌门(β-变形菌和γ-变形菌)为优势菌群。TOC/NH4~+-N从0逐渐增加至2.0的过程中,反应器中的反硝化菌(变形菌门)不断增长,Anammox菌群在TOC/NH4~+-N为0.4阶段得到最大程度的富集,此时反应器内部微生物多样性也最高;随着有机物含量增加,Anammox菌生长受到严重抑制,反应器微生物物种多样性也逐渐下降。荧光定量(qPCR)分析表明Anammox菌含量从1.30×1011 copies/mL下降至3.18×109 copies/mL,而DB含量从1.57×10~9copies/mL增加至3.74×1010 copies/mL。说明随着C/N的增加,反应器脱氮能力逐渐从Anammox过渡到反硝化过程。通过测定反应器内壁附着污泥,还发现其微生物丰度和含量均高于同时期反应器内部活性污泥样品,推测厌氧微生物菌群更适宜在静态基质生长。
中药通窍活血汤对脑缺血再灌注大鼠神经营养因子及氧自由基的影响
江颖;王凯华;方兴;何婷婷;戴芳;为了探讨通窍活血汤对脑缺血再灌注大鼠神经营养因子及氧自由基表达的影响,分析其可能的作用机制。本研究选择66只Wistar大鼠为实验动物,随机分为6组:空白组6只、假手术组12只、模型组12只、通窍活血汤低剂量组12只、通窍活血汤中剂量组12只和通窍活血汤高剂量组12只。除空白组外,其余大鼠建立大脑中动脉阻塞模型(middle cerebralartery occlusion,MCAO)。本研究分别给予通窍活血汤低剂量组1.0 g/m L生药浓度灌喂,通窍活血汤中剂量组给予1.5 g/m L生药浓度灌喂,通窍活血汤高剂量组给予2.0 g/m L生药浓度灌喂,空白组、假手术组及模型组给予等量生理盐水灌喂。在治疗后第7天、第14天,比较神经功能缺损程度、脑组织神经营养因子和氧自由基等指标。实验结果表明:治疗后第7天、14天,通窍活血汤组神经功能缺损评分均明显低于模型组(p<0.05),脑组织兔抗大鼠神经生长因子(NGF)、脑源性神经营养因子(BDNF)表达灰度值明显低于模型组(p<0.05),脑组织超氧化物歧化酶(SOD)明显高于模型组,丙二醛(MDA)明显低于模型组(p<0.05),且均呈剂量依赖性关系(p<0.05)。我们的研究结果初步表明,通窍活血汤有助于缓解脑缺血再灌注大鼠神经功能缺损程度,可能与促进脑组织神经营养因子表达、抑制脂质过氧化等因素有关。
基于PacBio平台的紫娟茶树全长转录组分析
夏丽飞;孙云南;宋维希;朱兴正;田易萍;蒋会兵;陈林波;紫娟(Camellia sinensis var. Asssamica (Masters) kitamura)是珍稀茶树种质的典型代表,其叶片色泽呈现紫色,富含花青素、儿茶素以及黄酮等活性成分。为探讨紫娟茶树叶片呈色以及次级代谢过程的遗传基础,以紫娟茶树为材料,采用Pac Bio平台进行全长转录组测序,最终获得Polished consensus序列205 911个。在NR数据库有163 519个同源序列比对到914个物种;有99 503个在KOG数据库得到注释,根据其功能分为26类;有76 829个得到GO注释,分为细胞组分、分子功能及生物学过程等3大类的54个功能组;根据KEGG数据库,109 748个被注释到216个代谢途径分支,其中氨基酸代谢的7 731个、类黄酮生物合成的有644个、单萜的合成的有57个、萜类化合物骨架生物合成487个、黄酮和黄酮醇的生物合成的有88个、花青素合成1个;同时预测到CDS有199 245个、转录因子有6 838个;此外,还检测到了180 293个SSR位点,其中以单碱基重复最丰富有103 535个,其次是双碱基43 240和三碱基30 883。本研究结果为开展紫娟茶树叶片呈色机理以及花青素、黄酮类等物质合成途径与调控机制和特异性状基因的标记性引物开发提供重要的数据支持。