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乳腺癌的临床诊断、形成机理及临床治疗
窦迪;罗雯;乳腺癌是由乳房组织发展成的癌症,是女性最常见的癌症,约占女性患癌的25%。在发达国家中,病患的存活率较高;而在发展中国家中,存活率则稍差,这可能与人们对乳腺癌的认知、早期筛查和有效的治疗有关。本研究系统阐述了乳腺癌的征兆和症状,乳腺癌的分类、分级及分期,乳腺癌的形成机理、临床诊断和临床治疗,以期全面了解和认识乳腺癌的发生和发展,为乳腺癌的预防和治疗提供参考和借鉴。
牙周炎与骨质疏松症关系的探讨
王丹;吴承芳;戚孟春;董鑫;王会;蒋秀梅;牙周炎和骨质疏松症是全球性公共卫生问题,严重影响着中老年人的健康。随着社会人口老龄化的增长,牙周炎和骨质疏松症的发病率也在逐渐增高,骨丧失是两种疾病的共同特征,且两者之间有一些共同的危险因素,如增龄、吸烟和内分泌等,这些危险因素影响着牙周炎和骨质疏松症的发生发展。近年来的研究表明牙周炎与骨质疏松症间存在着一定的关系,但国内外文献对牙周炎和骨质疏松症之间的具体关系尚存在争议,本研究对牙周炎与骨质疏松症之间的关系作一综述。本研究所说的骨质疏松是原发性骨质疏松症。
翘嘴鳜microRNA转录组分析及生长相关miRNA鉴定
王博;田园园;孙成飞;董浚键;叶星;MicroRNAs(mi RNAs)是一类内源性、长度约22 nt的非编码小RNA,通过转录后调控基因的表达水平、参与生物体的生长与发育等多种生理过程。翘嘴鳜是我国淡水经济鱼类,由于长期人工繁殖忽视亲本选育,导致鳜种质退化,出现生长速度及抗病力下降等问题。本研究中,我们以生长存在显著差异的慢长组和快长组翘嘴鳜肌肉为材料,通过HiSeq 2000深度测序技术和生物信息学分析miRNA转录组,鉴定出433个已知miRNAs并分析miRNAs种子编辑情况。Expdiff方法结合qPCR验证试验,证实了4个表达显著差异的mi RNAs:miR-122、miR-192、miR-451、let-7j-5p。对差异miRNAs进行靶基因预测并通过KEGG Pathway显著性富集分析,发现差异miRNA参与生长、发育、代谢、信号转导等途径,其中Wnt信号通路等在肌肉的生长发育过程起重要作用。本研究为进一步开展miRNA-靶基因的交互作用、了解其对鳜鱼生长的调控机制奠定了基础,并可为鳜鱼分子选育种提供候选基因。
eEF2K在代谢相关疾病中的作用研究进展
刘小梅;欧阳鑫;李岩;宋子仪;代谢相关疾病是一类由遗传和环境等多因素引起的慢性疾病。这些疾病已成为威胁人类健康的主要问题，然而目前缺乏有效的治疗方法。真核生物延伸因子2激酶(eukaryotic elongation factor 2 kinase, eEF2K)是一种特殊的蛋白激酶，其通过负调控蛋白质合成的延伸过程，与多种代谢相关疾病的发生密切相关。因此，eEF2K被认为是治疗代谢相关疾病的潜在靶点。本文从代谢角度综述了eEF2K在心血管疾病、 2型糖尿病、癌症以及部分神经系统疾病中的作用和机制，旨在探讨eEF2K作为代谢相关疾病治疗靶点的潜力，为防治代谢相关疾病提供理论参考。
四个鲤鱼种群遗传多样性的AFLP分析
钟立强;张成锋;周凯;李冰;王建新;朱健;本文采用AFLP技术对黑龙江野鲤、黄河鲤、建鲤和荷包红鲤4个鲤鱼种群共96个个体进行了遗传多样性分析。结果显示,8对选择性扩增引物共扩增得到502个位点,其中多态性位点273个,多态性比率为54.38%。同时对4个种群的Shannon多样性指数,Nei's基因多样性等参数进行了分析,结果表明,4个种群的Shannon多样性指数分别为0.2114±0.2705,0.1825±0.2694,0.1888±0.2587和0.1600±0.2426,Nei's基因多样性指数分别为0.1398±0.1872,0.1225±0.1863,0.1235±0.1774和0.1036±0.1636;总基因多样性(Ht)平均值为0.1721±0.0350;种群内基因多样性(Hs)平均值为0.1224±0.0190;基因分化系数(Gst)为0.2892,种群内的基因多样性占总群体的71.08%,种群间为28.92%,而基因流系数(Nm)为1.2291。另一方面,分子方差分析(AMOVA)结果表明,种群平均近交系数(Fst)为0.31191,变异31.19%来自种群间,68.81%来自种群内。4个种群中黑龙江野鲤的种内多态性比例最高,而荷包红鲤种群最低,并且4个鲤鱼种群当前的种质资源良好,具有一定的种群稳定性;建鲤已经开始分化,与亲本荷包红鲤亲缘关系逐渐分化,逐步形成自己稳定的遗传结构。本研究为探讨鲤鱼种群的遗传特性和遗传分化提供参考,也为其种质资源的保护及合理利用提供科学依据。
甘蔗黑穗病菌拮抗细菌的筛选及鉴定
廖咏梅,张桂英,黄定安,覃蔓萍,姚普远从甘蔗根际土壤及甘蔗不同组织内分离到的928个细菌菌株中,对甘蔗黑穗病菌有拮抗作用的细菌菌株有301个,占32.4%,其中拮抗能力强(拮抗带大于10mm)的菌株有18个,占1.9%。经在KBA培养基上培养,发现具有拮抗作用的细菌主要是荧光菌和非荧光菌中的白色菌群。在18个拮抗性强的菌株中,13个菌株来自甘蔗的茎、芽(生长点),占72%;5个菌株来自根际土壤,占28%;12个菌株为革兰氏阳性细菌中的芽孢杆菌属;6个菌株为革兰氏阴性细菌,其中4个菌株分别为假单胞杆菌属、不动杆菌属、伯克氏菌属及沙雷氏菌属,其余2个菌株有待进一步鉴定。
马铃薯TCP家族转录因子鉴定与表达模式分析
冯建英;李立芹;李佳皓;赵希胜;鲁黎明;TCP (teosinte branched1/cycloidea/proliferating cell factor)是植物特有的一类转录因子，参与植物的细胞信号传导，并在植物生长发育过程中发挥重要的调控作用。马铃薯(Solanum tuberosum)是世界四大粮食作物之一，为了探索TCP转录因子在马铃薯生长发育中的作用，本研究通过生物信息学方法，对马铃薯TCP转录因子进行了全基因组检索，并借助表达数据库对这些TCP转录因子进行了表达模式分析。本研究从马铃薯基因组数据库中检索出了27个StTCPs基因，长度为657～1 347 bp，编码氨基酸201～534个。马铃薯TCP蛋白均为亲水性蛋白，分子量为21 143.87～59 686.47 Da，等电点在5.22～10.08；除1个定位于细胞核和叶绿体外，其余26个TCP均定位于细胞核。保守基序分析结果显示，马铃薯TCP家族成员的保守基序构成不同，但均具有bHLH保守结构域。同源性分析结果表明，马铃薯TCP与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、烟草(Nicotiana tabacum)TCP的同源性较高，而与水稻(Oryza sativa) TCP的同源性较低。组织表达模式分析结果显示，马铃薯TCP基因的表达具有组织特异性。其中，StTCP16和StTCP19基因在马铃薯茎及幼小块茎中表达水平较高。响应诱导表达模式分析表明，StTCP13、StTCP22、StTCP24基因的表达受IAA等激素的强烈诱导；在盐和甘露醇胁迫下，StTCP13基因的表达量则明显降低。本研究结果为马铃薯TCP转录因子的生物学功能研究提供了基础。
马铃薯根结线虫抗性基因的电子克隆与序列分析
李婉琳;贺斌;肖继坪;郭华春;近年来,马铃薯受根结线虫的危害日益严重,造成减产、植株萎蔫、影响其商品性,并使其很容易受其他土传病害侵染。而不同马铃薯材料对根结线虫抗病性存在明显差异。因此,从分子角度挖掘和利用其本身所具备的抗病基因变得尤为重要。本研究采用电子克隆技术,搜索马铃薯EST数据库,拼接获得28 714条重叠群(contigs),以番茄、辣椒中已经克隆的根结线虫抗性基因作为探针,与所拼接的contigs进行比对及序列分析,共获得2条马铃薯根结线虫抗性基因的c DNA序列(contig_5164,contig_12247)。进一步采用生物信息学方法,对所得2条抗性基因序列进行了氨基酸组成和亲缘关系的分析。结果显示,contig_5164总长1 191 bp,推测编码206个氨基酸,等电点为4.77。Contig_12247总长892 bp,推测编码114个氨基酸,等电点为4.24。氨基酸组成均以亮氨酸最多,谷氨酸其次。两基因与番茄亲缘关系最近。随后对拼接所得contigs进行功能注释和GO分类,完成了对马铃薯中5类抗病保守结构域基因的挖掘。本研究的结果可为马铃薯根结线虫抗性基因进一步的研究与应用以及开发利用马铃薯抗性资源奠定基础。
氧化鱼油对草鱼(Ctenopharyngodon idelluspond)肝胰脏、肠道胆固醇、胆汁酸合成代谢的影响
黄雨薇;叶元土;蔡春芳;吴萍;陈科全;吴韬;徐登辉;彭侃;林秀秀;罗其刚;为了研究氧化鱼油对草鱼肝胰脏、肠道胆固醇、胆汁酸合成代谢的影响,本研究以豆油、鱼油、氧化鱼油作为饲料脂肪源,分别设计鱼油组(6F)、豆油组(6S)、2%氧化鱼油(2OF)、4%氧化鱼油(4OF)及6%氧化鱼油(6OF)5组等氮、等能半纯化饲料,在池塘网箱养殖平均体重为(74.8±1.2)g草鱼72 d。采用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)的方法,测定了草鱼肝胰脏、肠道组织中四种胆固醇合成相关酶HMGCR、SREBP2、CETP、ABCA1和胆汁酸合成关键酶CYP7A1的基因表达活性,结合血清、肝胰脏和肠道TC、TBA含量分析了胆固醇、胆汁酸的合成强度的变化。结果显示:(1)添加氧化鱼油后,草鱼肝胰脏HMGCR基因表达活性显著上调(p<0.05),ABCA1和CYP7A1基因表达活性显著下调(p<0.05),肝胰脏TC、TBA含量显著增加(p<0.05);(2)添加氧化鱼油后,草鱼肠道HMGCR基因表达活性显著上调(p<0.05),CYP7A1基因表达活性显著下调(p<0.05),肠道TC含量显著增加(p<0.05),而TBA含量显著减少(p<0.05);(3)添加鱼油或氧化鱼油后,饲料∑PUFA含量与肝胰脏ABCA1基因表达活性呈显著正相关关系(p<0.05),饲料MDA含量与肠道ABCA1基因表达活性呈显著负相关关系(p<0.05)。结果表明,随着饲料氧化鱼油添加量的增加,在饲料∑PUFA含量减少和鱼油氧化产物MDA含量增加的交互影响下,肝胰脏和肠道细胞胆固醇合成能力、向细胞内转运胆固醇的能力增强,向细胞外转运胆固醇的能力、以胆固醇为原料合成胆汁酸的能力减弱,致使肝胰脏、肠道、血清胆固醇含量增加、而血清、肠道胆汁酸含量减少。肝胰脏胆汁酸含量增加,显示肝胰脏有胆汁酸淤积的发展趋势。预示着鱼体生理代谢可能需要更多的胆固醇以满足生理代谢的需要,而鱼体胆汁酸可能出现供给不足。
栽培稻种间杂种不育基因S1的图位克隆
马生健;徐鹏;范永田;陶大云;刘耀光;水稻种间杂种不育限制了其杂种优势的有效利用,S1是其中一个最重要的杂种不育基因座。为探讨S1对杂种的雌雄配子选择性杀灭作用,本研究首先采用图位克隆法,对粳稻IRAT216及其包含非洲栽培稻S1座位的近等基因系IRAT216S1构建的BC_9F2分离群体,进行了S1精细定位与克隆。首先在定位区间内筛选了所有网上公开的SSR标记,并结合自行测序比较,开发出了31对有多态性的分子标记,把S1锁定在P0535G04克隆上标记2180与2198之间18 kb的精细定位区段,内有ORF11、ORF12两个候选基因。对两基因基因组测序、RT-PCR、基因芯片分析,排除了ORF11,确定了ORF12是唯一候选基因,同时也排除了此座外存在辅助因子的可能性。本研究分子标记的开发将为水稻的分子标记辅助育种提供帮助,而S1基因的克隆将为杂交育种中克服杂种不育提供了可能,也为进一步杂种优势的利用打下基础。