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三种伞形科蔬菜作物全基因组SBP基因家族的生物信息学分析
冯书燕;裴巧英;吴彤;崔春琳;赵唯;平霄瑞;巩克;宋小明;本研究利用生物信息学方法对三种蔬菜Squamosa启动子结合蛋白(squamosa-promoter binding protein, SBP)基因家族进行了系统的比较分析，包括家族鉴定、系统发育关系、结构及保守基序分析、染色体定位、基因丢失及保留、直系和旁系同源分析、基因表达模式和密码子偏好等分析。以葡萄(Vitis vinifera)为参考，在芹菜(Apium graveolens)、香菜(Coriandrum sativum)、胡萝卜(Daucus carota)和葡萄中分别鉴定到18、27、21、19个SBP家族成员。系统发育分析表明，85个SBP基因共分为6组，即Group 1～Group 6。结合4个物种SBP基因的结构和保守基序分析，发现每个物种SBP家族成员均具有Motif1、Motif2和Motif7，具有高度的保守性。另外，鉴定到4个物种SBP家族中共有42个基因丢失，44个基因复制，说明该基因家族在这4个物种的进化过程中整体数量并无太大波动。通过密码子偏好分析发现这些物种具有共同偏好的唯一密码子AGU，这对伞形科物种进行转基因改良具有重大指导意义。本研究结果为进一步探究植物生长发育及改良育种提供理论基础。
天然药物抗甲型流感病毒的研究进展
许朋;余兰;甲流是一种由病毒感染引起的急性呼吸道传染病,具有致病性高、传染性强等特点,曾在世界范围内多次大流行,困扰人们的日常生活甚至威胁身体健康。伴随着现代药物分离、纯化技术的发展,天然药物的活性成分研究为新药开发带来了第二个春天,也使天然药物抗流感病毒引起越来越多的关注,本综述总结大量研究成果,阐明了利用天然药物进行抗流感病毒研究的可行性与有效性,为进一步开发、利用天然药物提供依据。
玉米Lc基因植物表达载体构建及菊花转化
王娟;韩科厅;戴思兰;Lc基因是从玉米中分离得到的与花青素合成相关的调节基因,它在多种植物中的异源表达可以增加花青素的含量。本研究对pBI121载体Gus基因后的终止子进行2次PCR扩增,在原SacⅠ酶切位点后添加了新的SacⅠ酶切位点,利用组织化学染色法检测,结果表明改造后的载体上的Gus基因能正常表达,终止子功能正常,载体改造成功。用改造的pBI121N构建了含有Lc基因的植物表达载体pBI121N-Lc,利用农杆菌介导法转化菊花叶盘,获得了19株生根抗性苗。通过提取抗性苗基因组总DNA,PCR扩增Lc基因和CaMv35S启动子获得了11个阳性株系,PCR结果表明Lc基因已经转入菊花中。同时,在已获得的转基因植株中发现7个株系的根系有变红的现象。
玉米全基因组测序完成
<正>2009年11月19日美国圣路易斯华盛顿大学、亚利桑那大学、爱荷华州立大学、冷泉港实验室,印度理工学院等机构宣布玉米全基因组测序完成,并于11月20日出版的国际著名杂志《Science》上公布。
水牛泌乳期与干乳期差异血清生化指标及代谢物研究
丁子旭;徐祎雪;冯彤;王艳;崔奎青;李志鹏;杨春艳;刘庆友;本研究旨在比较泌乳期与干乳期水牛(Bubalus bubalis)差异血清生化指标及差异血清代谢物的组成，探讨血清生化指标与代谢物的相互关联，进一步了解水牛营养代谢过程的调控机制。选取泌乳期(泌乳第100～200天)健康水牛9头和干乳期(停乳后第30～60天)健康水牛9头，每头牛采血清样本两份，一份用生化分析仪进行20项指标检测；另一份用超高效液相色谱-串联质谱法(ultra-high performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry, UPLC-MS/MS)检测分析水牛血清中内源性代谢物。在生化指标检测结果中，泌乳期的谷草转氨酶/谷丙转氨酶(P<0.05)、甘油三酯(P<0.01)显著低于干乳期的，说明水牛在泌乳期时对酯类物质的利用效率更高；而泌乳期的胆固醇(P<0.01)、低密度脂蛋白(P<0.01)、高密度脂蛋白(P<0.001)、尿素氮(P<0.01)、葡萄糖(P<0.01)和免疫球蛋白A(P<0.000 1)等指标显著高于干乳期的，说明泌乳期时水牛的物质代谢更高。对于血清代谢物进行分析得出共有183种代谢产物在2个时期中存在显著差异(P<0.05, VIP> 1),这些代谢产物共富集到8条显著不同的代谢途径，分别是D-谷氨酰胺和D-谷氨酸代谢，精氨酸和脯氨酸代谢，色氨酸代谢，卟啉和叶绿素代谢，甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢，组氨酸代谢，不饱和脂肪酸的生物合成，以及氮代谢(P<0.05)。这些结果说明在泌乳期时，水牛吸收的营养物质主要用于参与多种氨基酸的合成及脂肪酸的合成与利用。
脑默认网络的神经机制及临床应用研究进展
张艳波;郑金瓯;近年来,研究发现默认网络(default mode network,DMN)在阿尔兹海默病(Alzheimer disease,AD)、癫痫(epilepsy)、抑郁(depression)等疾病中表现活动反常。这种反常表现引起了诸多神经科学者的关注,并据此提出了默认网络的相关理论,相关研究也取得积极进展。研究默认网路的活动有助于了解疾病的发展程度及临床治疗评估,具有非常重要的意义。本研究将对默认网络的研究历史、解剖基础、神经机制、及其与疾病的关系以及临床应用等方面进行综述。
盆栽干旱条件下玉米材料的干旱耐受性鉴定及胁迫响应基因的表达研究
徐勇;周燕;李有志;玉米抗旱性状和表型极为复杂多样,主要涉及到根系生长。因此,鉴定根的生长表型非常必要。但是,玉米根系与耐旱性之间相关性仍然不明确。此外,干旱会引起两种类型的细胞变化(创伤/损伤和细胞膜稳定性)。目前人们对这两组基因的表达与玉米中抗旱表型之间的关联了解甚少。本研究在土壤相对含水量为32.0%的温室盆栽条件下对抽雄前六叶期的28种具有温带和热带种质的玉米材料(包括26个玉米优良自交系和2个杂种)的表型(地上和地下部分)进行了鉴定,并且对一个创伤/损伤诱导蛋白和一个疏水蛋白基因的表达进行了分析。结果表明,根的长度和密度(轴根和次生侧根)的确与玉米的耐旱性有关,然而,并非所有玉米材料根长都会在干旱条件下显著增加。创伤/损伤诱导蛋白基因和膜疏水蛋白的基因在叶片中的高表达和在根部中的低表达可能有助于增强玉米的抗旱能力。
基于转录组筛选黑安格斯牛肉质性状关键调控基因
马正旭;虎红红;封元;黄增文;冯小芳;蔡正云;张娟;王瑜;母童;顾亚玲;为了对黑安格斯牛肉质性状关键调控基因进行筛选,本研究分别以3头24月龄的黑安格斯牛和西门塔尔牛背最长肌为试验材料,在运用Illumina HiSeqTM技术对所有样品进行转录组测序后利用生物信息学方法和相关软件对测序结果进行归类分析。通过分析得到黑安格斯牛与西门塔尔样本间的差异表达基因有409个,其中上调基因115个,下调基因294个。进一步分析发现与肉质性状相关的基因PPARD表达量在黑安格斯中显著高于西门塔尔(P<0.01),对此运用RT-qPCR技术进行验证得到的实验结果与转录组结果一致。这些研究结果不仅表明黑安格斯牛中的PPARD表达量比西门塔尔牛的高,还说明该基因对牛的肉质具有一定的调控作用,也对宁夏地区安格斯牛的选育及核心安格斯牛种群的建设具有一定的参考价值。
蓬莪术根茎总黄酮的提取及体外抗氧化分析
李洋益;高刚;张艳;邓家彬;童珊珊;张仲豪;杨瑞武;为了合理地开发和利用蓬莪术的药用价值,通过响应面法对蓬莪术根茎总黄酮超声波辅助提取进行工艺优化,并探究粗制黄酮和纯化黄酮的还原力和对DPPH、羟基自由基、超氧阴离子的清除能力。结果表明,在超声功率300 W的条件下,以乙醇浓度80%、液料比40 mL/g、超声时间50 min、超声温度70℃的提取效果最佳,总黄酮得率为1.593%。在体外抗氧化活性分析中,蓬莪术根茎粗制黄酮对DPPH、羟基自由基、超氧阴离子及还原力的IC50值分别为1.255 mg/mL、0.597 mg/mL、1.041 mg/mL和3.508 mg/mL,而纯化黄酮的IC50值分别为0.333 mg/mL、0.076 mg/mL、0.084 mg/mL和1.477 mg/mL。因此,响应面可以很好的对蓬莪术根茎总黄酮超声辅助提取进行优化,且粗制黄酮和纯化黄酮都具有良好的抗氧化活性。
梭梭NAC转录因子家族基因的克隆和转录激活分析
韩聚东;张桦;倪志勇;姚正培;王泽;任财;陈全家;麻浩;以梭梭NAC转录组测序结果设计特异引物,成功克隆5个梭梭NAC转录因子。通过与其它物种NAC蛋白进行多重比对,表明克隆的5条序列具有NAC转录因子所共有的5个典型亚结构域。通过构建p GBKT7融合表达载体,将其转入AH109酵母菌中进行转录激活功能分析。结果显示含有Ha NAC10、Ha NAC17、Ha NAC18、Ha NAC21转录因子的重组酵母菌可以在SD-Trp-His-Ade缺陷培养基平板上生长,X-gal检测显蓝色。这表明Ha NAC10、Ha NAC17、Ha NAC18、Ha NAC21可以激活下游报告基因表达,说明其具有转录激活活性;Ha NAC16不具备转录激活活性。为进一步分析梭梭NAC转录因子功能和调控机制提供帮助。