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人源脱硫弧菌属的分离鉴定及脱硫性能评价
靳文会;张羽;黄琳婷;马丽君;孙鹤洋;任怡琳;耿燕;硫酸盐还原菌(sulphate-reducing bacteria, SRB)是一类广泛存在于厌氧环境中的细菌的总称，在肠道微生物群中扮演着重要的角色。其中脱硫弧菌属(Desulfovibrio, DSV)作为人肠道中SRB的优势菌群，其数量和多样性可能与某些肠道疾病的发生存在一定的联系，因此对人体肠道中DSV的进一步研究显得十分必要。本研究从6名健康青年志愿者的粪便中分离出50株JN-SRB菌株，其中18株菌通过16S rRNA序列的测序和比对、构建系统发育树，并结合形态学及生理生化特性进行分析。结果表明，18株菌都为DSV菌株，通过与GenBank中登录的菌株比对，菌株JN-SRB-1、JN-SRB-2、JN-SRB-6、JN-SRB-7、JN-SRB-9、JN-SRB-11、JNSRB-14、JN-SRB-15、JN-SRB-16鉴定为Desulfovibrio desulfuricans；菌株JN-SRB-4、JN-SRB-5、JN-SRB-10、JN-SRB-17鉴定为Desulfovibrio fairfieldensis；菌株JN-SRB-3、JN-SRB-8、JN-SRB-12、JN-SRB-13鉴定为Desulfovibrio intestinalis；菌株JN-SRB-18鉴定为Desulfomonas pigra。对18株JN-SRB进行了脱硫性能的研究，其中菌株JN-SRB-7还原能力最强，经培养，SO42-清除率可达89.26%。
高钙逆境对拟南芥根部基因表达的影响
李菲;张琴;唐明;乙引;土壤钙含量过高会对植物正常生长发育形成严重的威胁。这是中国西南喀斯特区域农业生产和环境保护的重要限制因素。了解植物对高钙胁迫的响应机制,可以促进喀斯特地区可持续农业发展和生态环境保护。为揭示植物对高钙胁迫相应的分子机理,本研究充分利用拟南芥(Arabidopsis thaliana)丰富的生物信息资源,系统比较和分析了对照和高钙胁迫处理情况下拟南芥根部的基因表达情况。40 mmol/L CaCl2处理明显抑制了拟南芥根部生长。转录组分析表明,高钙处理下,拟南芥根部乙烯、脱落酸和茉莉酸途径表达上调,其中,茉莉酸合成、响应和代谢途径相关基因表达均上调,说明这3个激素相关途径,对植物应对高钙胁迫具有重要的作用,尤其是茉莉酸相关途径。
冠突散囊菌不同生殖方式的比较转录组学分析
胡治远;刘石泉;徐正刚;董萌;冠突散囊菌(Eurotium cristatum)是黑茶中的优势微生物，其存在差异较大的有性型和无性型生殖方式，本研究旨在分析冠突散囊菌两种生殖方式下的基因表达差异，为其生殖发育研究提供数据。对冠突散囊菌有性型和无性型的菌体进行转录组测序，分析与两种生殖方式相关的基因及其表达机制。结果表明，两种类型菌体转录组序列中共发现了3 810个差异表达基因(DEGs)，主要富集在次生代谢产物、生物膜、氨基酸的生物合成等相关代谢通路中，负责调控氧化还原反应、催化活性、金属离子结合以及跨膜转运等。通过对DEGs进行功能分析，从中筛选了chsD、chsC、HOP1、DMC1、MAT1-2和wetA等66个可能在冠突散囊菌生殖过程中起关键调控作用的基因，主要在孢子壁合成、性别分化、钙离子代谢途径等方面行使功能，其中MAT1-2、wetA已被验证在冠突散囊菌性别分化及孢子形成过程中具有重要作用。本研究为冠突散囊菌生殖调控及高效产孢发酵技术提供了基础。
中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)全基因组微卫星分布特征研究
徐杰杰;毕宜慧;程景颢;邢秀梅;暨杰;王涛;尹绍武;张凯;本研究利用MISA软件对中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)全基因组微卫星进行了筛选并对其分布特征进行了深入分析。结果显示：在中华绒螯蟹全基因组中，共筛选出886 782个完整型微卫星，相对丰度为572个/Mb。总长度为14 620 825 bp，占全基因组序列长度的0.94%，相对密度为9 438 bp/Mb。在六种完整型微卫星中，单碱基微卫星的数目最多，共有595 093个，占基因组中微卫星总数的67.11%；其他依次为二碱基(19.28%)、三碱基(11.73%)、四碱基(1.56%)、五碱基(0.30%)和六碱基(0.03%)类型微卫星。中华绒螯蟹全基因组中前十种优势微卫星分别为A,AC,AG,AGG,C,AT,ACT,ACC,AAT和AAG。本研究为深入研究中华绒螯蟹基因组特征以及进一步开发微卫星引物等提供了数据支持。
三角梅下胚轴再生体系的建立
陆锦萍;冷青云;赵彤;孙鲁平;徐世松;尹俊梅;牛俊海;本研究以三角梅(Bougainvillea glabra)品系‘Bouform 1’种子下胚轴为外植体，通过研究在MS培养基上添加不同的植物生长调节剂，其在诱导分化以及不定芽增殖、壮苗、生根等阶段的生长状况，以期筛选出最适宜其生长的培养基，建立稳定有效的再生体系。结果表明：下胚轴诱导分化最佳培养基为MS+IBA(吲哚丁酸)0.1 mg/L+6-BA(6-苄氨基嘌呤) 2.0 mg/L，分化率和平均分化芽数为81.35%和7.04个；不定芽增殖最佳培养基为MS+NAA(萘乙酸) 0.05 mg/L+6-BA 3.0 mg/L，增殖系数达到5.22；壮苗最佳培养基为MS+NAA 0.1 mg/L+6-BA 1.0 mg/L，平均苗高达到5.59 cm；不定芽生根最佳培养基为1/2 MS+NAA 0.2 mg/L，生根率和平均生根数最高，分别为82.54%和4.38条。本研究建立的三角梅下胚轴再生技术，为后续离体突变体诱导、多倍体育种及遗传转化体系的建立提供了技术保障。
利用SSR与RAPD分子标记评估甘蔗品种的遗传多样性
胡杨;李赟;黄有总;刘平武;利用SSR与RAPD两种分子标记对美国、中国台湾以及中国大陆不同甘蔗育种单位选育的甘蔗品种或亲本材料的遗传多样性进行评估。其中19对SSR引物共扩增出87条带,多态性带为84条,多态性比例为96.55%,扩增出的条带数范围为28条,平均每对引物扩增出4.58条带,引物的PIC值范围为0.340.93,平均0.64。21条RAPD引物共扩增出184条带,扩增条带数范围为3~16,平均每条引物扩增8.76条带,其中多态性带为184,多态性比例为100%,引物PIC范围为0.530.97,平均0.86。结果表明,两种分子标记都能较好的评估甘蔗品种的遗传多样性。
人Ⅱ型肝脏表达抗菌肽LEAP-2的生物信息学分析
王珊珊;高琪;任艳艳;路宏朝;王令;张涛;人Ⅱ型肝脏表达抗菌肽(LEAP-2)作为新型活性多肽，具有抑菌活性和调节体重的功能。为了深入认识人LEAP-2的基本信息，本研究利用在线生物软件和工具进行了全面系统的生物信息学分析。一级结构分析结果表明，人LEAP-2含有77个氨基酸残基，包括18种氨基酸，分子量为8.81 kDa,理论等电点为10.31,为不稳定亲水性蛋白，由信号肽、前体肽和成熟肽三部分组成，有4个糖基化和7个磷酸化修饰位点。二级结构主要元件为α螺旋和无规则卷曲。成熟肽三维结构由N端疏水柔性区、中央刚性核心区和C端柔性区组成，两对二硫键稳定空间构象。多序列比对结果表明，不同物种LEAP-2的信号肽和前体肽序列差异较大，但成熟肽序列具有极高的相似度，在长期进化过程中高度保守。系统进化树分析表明，在不同物种中LEAP-2的分子进化过程与物种亲缘进化关系基本吻合。研究结果为LEAP-2生物学功能及其分子机制的深入研究提供了理论基础。
核心训练搭配阻力训练可显著提升女子网球运动员技能表现
樊云;为了探讨6周核心训练搭配阻力训练对女子网球运动员在网球技能表现的影响,本研究招募24名高水平女子网球运动员为受试者,随机分为8名核心训练组(core exercise, C)、8名核心训练搭配阻力训练组(core exercise with resistance xercise, CR)与8名控制组(control, CON)。3组皆进行常规的网球训练,但C及CR组包含额外的核心与阻力训练,频率为每周3次,每次训练约90 min。各组于6周训练前、后皆进行ITN(international tennis number)测验。本研究数据显示,CR组底线击球深度、底线击球准确性、截击深度、发球准确性及移动能力的后测结果皆显著优于前测(p<0.05);另外,CR组ITN级数与总得分的提升幅度均优于C组与CON组(C组进步10.2%,CR组进步32.3%,CON组进步7.0%)(p<0.05)。本研究表明,女子网球运动员在6周核心训练搭配阻力训练的训练模式下,能显著提升网球技能表现。
靶向核酸酶在线粒体基因组编辑中的应用
杨庆先;管敏鑫;线粒体基因组(mt DNA)的突变可导致多种人类疾病,其中绝大多数的mt DNA突变是异质性的:即在细胞中同时存在突变型和野生型的mt DNA,当突变型mt DNA的比例达到一定阈值时,就会引发疾病的发生。线粒体靶向的核酸内切酶可以诱导mt DNA异质性的改变,将突变型mt DNA的含量控制在发病阈值之下,从而达到疾病治疗的目的。本研究介绍了线粒体靶向的锌指核酸酶(ZFN)、类转录激活样效应因子核酸酶(TALEN)、规律成簇间隔短回文重复序列(CRISPR/Cas)以及常规的限制性核酸内切酶(restriction endonuclease,RE)在线粒体基因组编辑及疾病治疗中的应用。
长链非编码RNA与卵巢癌
李淑娟;唐一通;长链非编码RNA(long noncoding RNA,lnc RNA)是指转录本长度超过200个核苷酸且不编码蛋白质的一类RNA分子。Lnc RNA在人类肿瘤发生中发挥着重要作用,可在表观遗传学、转录及转录后水平调控基因表达,影响肿瘤的发生、发展,并且与肿瘤侵袭、转移及患者预后有一定关系。越来越多的研究表明,lnc RNA在卵巢癌中异常表达,发挥着癌基因或抑癌基因活性,可成为卵巢癌分子诊断和基因治疗的潜在靶点。本文就lnc RNA的作用机制以及在卵巢癌中的研究进展进行简要综述。