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髋关节置换术后患者早期康复锻炼有利于髋关节功能的恢复
谭春尼;李金洪;为探讨早期康复锻炼对髋关节置换患者肢体功能和生活质量的影响,本研究选取2016年5月至2017年5月期间在重庆市九龙坡区人民医院行髋关节置换术的患者156例,按照随机数字表法均分为试验组和对照组,每组78例。对照组患者给予常规康复及护理,试验组患者采用心理、康复指导训练并制定个体化的康复方案进行早期康复锻炼。比较两组患者治疗前后Barthel指数及Harris积分,评价肢体功能恢复质量。结果表明,两组患者治疗后Barthel指数,试验组为80.15±17.63,对照组69.15±11.34;治疗后Harris积分,试验组90.36±8.41,对照组73.42±10.98,试验组优于对照组,差异有统计学意义(p<0.05)。试验组术后深静脉血栓发生率为2.46%,感染发生率为7.58%,髋关节脱位发生率为0%,并发症的发生率为17.43%,均低于对照组,差异有统计学意义(p<0.05)。试验组患者在生理健康水平得分(89.42±4.29)、心理健康水平得分(82.37±4.93)、独立能力水平得分(71.69±6.14)以及社会支持得分(68.49±4.11)等方面的得分均明显高于对照组,差异有统计学意义(p<0.05)。本研究初步表明,早期康复锻炼有利于髋关节置换术后患者髋关节功能的恢复,可减少并发症的发生,提高生活质量。
合浦珠母贝海洋酸化和温度胁迫下基因共表达网络分析
黄荣莲;郑哲;张国范;利用共表达网络分析法(WGCNA)筛选出合浦珠母贝外套膜在高温胁迫下影响显著的1个响应基因模块和海水酸化胁迫下的5个响应基因模块,并对模块中包含的基因进行功能富集;分析贝壳蛋白与模块其他基因的关联性,构建矿化基因的应激网络。高温显著响应模块基因富集结果显示细胞骨架蛋白发生了显著的变化,如ARHGEF4、SAP和myosin。酸化应答模块共5个,响应的基因包括呼吸相关的血红素A合成酶、芳香族氨基酸代谢相关的酶、钙粘蛋白和血小板反应蛋白等。另外,高温应答模块聚集了最多矿化基因,包括MSI、Tyrosinase、Fibronectin-like protein等重要的矿化基因,说明这些矿化基因对温度较为敏感。构建基因共表达网络的结果显示钙离子结合蛋白、细胞骨架蛋白、蛋白质糖基化相关的基因关系密切。
嗜热古菌超高温α-淀粉酶在枯草芽孢杆菌中的分泌表达
檀瑞婷;张康;吴敬;本研究将来源于嗜热古菌Pyrococcus furiosus的超高温α-淀粉酶基因在枯草芽孢杆菌中成功表达,通过信号肽筛选和伴侣蛋白基因共表达提高超高温α-淀粉酶在枯草芽孢杆菌中的分泌表达,并对重组超高温α-淀粉酶的酶学性质进行初步研究。首先构建信号肽筛选文库,结合高通量筛选方法对枯草来源的173种信号肽进行筛选,最终筛选出一种新的信号肽AspB',引导PFA胞外分泌表达,摇瓶发酵60 h后其酶活达到119.01 U/mL。在此基础上,共表达伴侣蛋白PrsA,使酶活进一步提高,发酵培养60 h后其酶活进一步提高12.72%,达134.15 U/mL。该菌株发酵潜力较好,摇瓶培养310 h后其酶活可达938.35 U/m L。对枯草芽孢杆菌中重组PFA的酶学性质进行测定,最适反应温度为100℃,最适反应pH值为4.5,在100℃条件下处理4 h仍有50%以上的酶活,在pH值4.5~7.0的条件下其稳定性良好。这在淀粉制糖工艺中具有重要的工业价值。
雄性不育枸杞花药比较转录组分析
张兴;冯嘉馨;陈佳;范文强;王路瑶;岳思君;郑蕊;为筛选宁夏枸杞(Lycium barbarum L.)雄性不育花药发育相关的差异表达基因,本研究开展了雄性不育品种‘宁杞5号’和可育品种‘宁杞1号’成熟花粉时期花药转录组分析,共获得差异表达基因1 759个,在‘宁杞5号’中有753个基因上调表达,1 006个基因下调表达。KEGG富集表明,这些差异表达基因主要富集到氨基酸的生物合成、植物激素信号传导、苯丙素生物合成、淀粉和蔗糖代谢、脂肪酸代谢等相关通路。对有注释信息的差异表达基因进行NR和Uniprot数据库检索,筛选到28个花药发育相关基因,其中有20个在‘宁杞5号’中下调表达,8个上调表达。选取其中的5个差异表达基因进行RT-qPCR验证,结果与转录组数据趋势一致。甘油醛-3-磷酸脱氢酶(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, GAP)、束状阿拉伯半乳糖蛋白3(Fasciclin-like arabinogalactan protein 3,FLAs)和花药特异表达启动子LAT52系统发育树分析表明,3个基因分别与同科的物种在同一个进化分支上且同源性较高。这些差异表达基因可能在宁夏枸杞‘宁杞5号’成熟花粉时期花药发育及雄性不育的发生中发挥重要作用。研究结果为进一步研究宁夏枸杞花药发育及其调控机制、雄性不育发生的分子机制提供了参考依据。
不同生长阶段水牛血清代谢物差异比较研究
刘淼儿;丁子旭;徐祎雪;冯彤;王艳;崔奎青;罗西尔;李志鹏;刘庆友;本研究旨在比较不同生长阶段的水牛(Bubalus bubalis)血清生化指标以及血清代谢物,以期发掘差异血清生化成分和差异代谢标志物。随机采集30头不同生长阶段(10头犊牛哺乳期、 10头断奶期、 10头成年期)的水牛血清样本,分别用于测定血清生化指标和血清内源代谢物。研究结果表明,3个生长阶段之间均有显著差异(两两对比P<0.05)的指标分别是尿素氮、甘油三酯、免疫球蛋白A、总胆固醇和间接胆红素。与成年期水牛相比,犊牛哺乳期水牛总胆固醇水平较低,因为瘤胃吸收的醋酸盐丰度较低和对糖异生的依赖程度较低。血清代谢组比较分析发现,在正负离子模式下分别鉴定出4 824种和11 522种代谢物,从3个生长阶段两两比较后的差异代谢物中筛选到12种血清差异代谢物,包括1,3,7-三甲基尿酸、可可碱、甲基黄嘌呤、尿囊酸、胞苷、 3-尿苷丙酸和花生四烯酸等。在不同生长阶段的水牛之间主要在氨基酸和脂肪酸合成代谢通路存在显著差异,说明在水牛犊牛哺乳期向断奶期过渡时,蛋白质代谢途径显著提高,因此建议在基础日粮里适量添加蛋白质,旨在保障水牛健康生长,提高水牛对饲料的利用效率。成年水牛血清中的甲基黄嘌呤和色氨酸含量高,说明成年水牛相较幼年水牛抗氧化能力和免疫能力显著提高。
罗布麻AP2/ERF转录因子全基因组鉴定及生物信息学分析
谢博勋;李国旗;解盛;刘星;张柯雨;王雅芳;AP2/ERF类转录因子存在于植物中并对植物生长、发育和逆境响应有重要的调控作用。为研究罗布麻(Apocynum venetum)中AP2/ERF转录因子家族成员性质,本研究基于罗布麻的全基因组数据,结合生物信息学研究方法,对罗布麻中AP2/ERF转录因子进行鉴定和分析。在罗布麻中共鉴定102个AP2/ERF转录因子,结合保守结构域特征和拟南芥(Arabidopsis thaliana)家族成员序列比对,可以分为4个亚家族:AP2、RAV、ERF和DREB。根据生物信息学的分析,该家族的转录因子都是亲水性蛋白质,富含酸性氨基酸,并且大多数成员是非分泌蛋白质。根据染色体定位,100个基因不均匀分布在罗布麻的11条染色体上,多条染色体上的AP2/ERF基因存在串联复制现象。芯片表达分析表明102个成员在植物的生长发育和逆境反应中起着重要作用,可以被低温、高温、光照、遮光、紫外线和脱落酸(ABA)处理诱导,并可以在根、茎、叶、花、果实和种子中表达。同时结合蛋白互作分析及启动子分析推测该基因家族成员在罗布麻的生长发育及对低温、干旱及盐胁迫等多种逆境的生理反应过程中具有重要作用。本研究将为罗布麻AP2/ERF基因家族后续的功能验证奠定基础,同时也在其他物种的AP2/ERF转录因子家族的抗逆性功能研究中具有重要意义。
不同发育阶段檫木人工林树高、胸径与树冠结构关系的动态关系分析
万志兵;李秀芹;刘成功;孙洪刚;汪小飞;方乐金;为充分解析檫木人工林生长发育进程中林冠(冠宽,活冠比,冠形率)变化规律及其与胸径和树高的相关性,本研究对安徽省休宁县岭南国有林场檫木林生长进程中幼龄林、中龄林、近熟林、成熟林、过熟林的胸径和树高与树冠因子关系进行了相关分析和通径分析。研究发现:冠宽随林龄增加而增大,幼龄到中龄期增长最快,达33.33%,冠宽变幅为0.77.0 m;从分级效果来看,冠宽小于0.5 m和大于4.5 m及活冠比小于0.2和大于0.9的林木极少。胸径和树高与冠宽的相关性达到显著或极显著正向水平,并在总体上对冠宽起正向作用;随林龄的增大胸径和树高对冠宽的正向作用逐渐减弱,且除过熟林外胸径对冠宽的影响作用要高于树高对冠宽的作用;胸径和树高对冠形率的直接作用大于间接作用,且胸径弱于树高;胸径对于活冠比的作用在幼龄林阶段存在较大的正向作用,随着生长期的延伸作用开始趋于稳定,树高对活冠比的作用整体上逐渐减小,且在中龄林时出现了负向作用。
徐闻方斑东风螺暴发性疾病病原分离鉴定以及防治手段探索
黄瑜;汪志文;周维;蔡小辉;张海艳;鲁义善;简纪常;汤菊芬;为了明确引起方斑东风螺急性死亡症的病原,对2015年6月广东省徐闻县发生的方斑东风螺(Babylonia areolata)急性死亡症进行了病原分离纯化,获得1株优势细菌,命名为XW-01。将XW-01人工感染方斑东风螺,表现出自然发病症状,证实分离菌株为致病菌。分离的菌株经形态学观察、生理生化鉴定和病原16S r RNA序列分析,结果显示该病原菌为哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)。XW-01对方斑东风螺半致死剂量(LD50)测定值为6.3×106 cfu/m L。药敏试验结果显示,该病原菌对常见的7种抗菌药物氟哌酸、氟苯尼考、氨苄西林、恩诺沙星、头孢三嗪、左旋氧氟沙星和妥布霉素敏感。添加不同剂量的三联生物噬菌王产品到水族箱中,对方斑东风螺用浸泡法进行人工感染哈维氏弧菌试验,观察东风螺发病及死亡情况。试验结果表明,添加1%的此产品可以明显降低东风螺的死亡率,表明三联生物噬菌王产品对东风螺感染哈维氏弧菌所引起的急性坏死病有明显的预防作用。
肿瘤浸润淋巴细胞与乳腺癌治疗及预后的关系
张铭;王成龙;曹友德;乳腺癌是女性常见的一种恶性肿瘤,具有较高的发病率及死亡率。随着免疫治疗概念的兴起,肿瘤浸润淋巴细胞(tumor-infiltrating lymphocytes,TILs)开始成为肿瘤免疫的形态学评价标志物。TILs在许多方面对乳腺癌具有潜在的临床应用价值,大量研究证实其可以作为乳腺癌新辅助化疗后效果及预后的预测指标。同时,对于TILs的评估已不再局限于浸润性乳腺癌中,乳腺导管原位癌(ductal carcinoma in situ,DICS)及转移性乳腺癌亦成为研究新领域。在此,本综述将围绕TILs与各类乳腺癌的预后、治疗关系予以阐述,从而体现TILs对当前乳腺癌病理及临床的实际应用价值所在,并对今后的研究方向做出展望,以期为乳腺癌的诊治规范提供新思路。
水稻小穗异常发育调控关键基因的加权共表达网络分析
吴迪;曾尹帝;罗继景;水稻(Oryza sativa L.)是世界上需求量最大的粮食来源之一,其产量和品质与分蘖和花序结构的发育有关。以往的花序发育研究已经鉴定出大量与水稻营养生长和生殖生长相关的基因,但对花序发育和抽穗期的遗传机制尚未完全了解。本研究利用前期构建的水稻小穗异常发育表型的重组自交系(recombinant inbred lines, RIL),通过转录表达谱分析,探讨穗部异常发育和穗部缺陷(pds1)表型调控的分子机制。通过差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)的筛选,鉴定了可能与pds1表型相关的基因。在6组差异表达基因中,分别鉴定出1 578、 463、 1 295、 687、 397、 175个差异表达基因。本研究通过加权共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis, WGCNA),发现了与pds1表型高度相关的4个基因模块(Module)。通过对模块中所包含的基因进行功能富集分析,发现与花序发育相关的生物学过程。随后在这些模块中鉴定出多个高度相关的关键基因(Hub genes),如开花促进因子OsFKF1(Os11g0547000)和TCP转录因子OsTB1(Os03g0706500)。结果表明,水稻小穗异常发育和抽穗缺陷表型可能是由小穗发育调控相关基因的遗传互作引起的。研究结果为进一步探讨穗伸长缺陷的调控机制提供了有价值的参考。